咸陽城中依附胡亥的商賈富戶，共計六十二家，多是經營鹽鐵、糧食、綢緞的大商賈，當年為獲取營商特權，投靠胡亥，為其提供錢財、藏匿物資、傳遞訊息，是胡亥暗中培養勢力的錢糧後盾。
對於這些商賈，贏璃沒有趕盡殺絕，畢竟咸陽商業運轉，離不開這些商賈，若盡數抄家，勢必會引發咸陽物價波動、商業動盪，影響民生。
他採取“剝奪特權、罰沒家產、恩威並施、嚴加管控”之策，下令剝奪這些商賈所有的朝廷特許營商權，收回鹽鐵專營資質，罰沒半數家產充入國庫，用於軍備糧草、水利民生、賑災救濟；同時下旨警告，若再有勾結亂黨、囤積居奇、哄抬物價之舉，即刻取締所有產業，全家流放邊關。
這些商賈失去了胡亥這個靠山，又被敲打掉半數家產，早已嚇得魂飛魄散，哪裡還敢有半分異心，紛紛跪地謝恩，承諾日後安分守己、誠信經營，全力配合朝廷調控物價、保障物資供應。此舉既敲打了不法商賈，斷絕了胡亥殘餘勢力的錢糧來源，又充盈了國庫，還穩定了咸陽商業秩序，一舉三得。
太醫院、將作監、內侍省等宮中底層吏員，涉事者共計八十五人，皆是負責宮中雜役、物資、醫藥的底層人員，被胡亥收買，負責在宮中傳遞訊息、監視贏璃與始皇的起居動向。
這些人雖無實權，卻身處皇宮腹地，是最容易引發宮變、傳遞隱秘訊息的隱患。贏璃沒有絲毫留情，下令將所有涉事吏員，悉數驅逐出宮，永不錄用，同時對宮內所有內侍、吏員進行重新核查，更換一批忠心可靠之人，由錦衣衛嚴加管控，杜絕宮內再出現細作眼線，徹底斬斷皇宮與外界的隱秘勾結渠道。
整個清查過程，歷時整整半月，牽連三百餘人，卻無大規模動亂、無冤假錯案、無百姓恐慌，雷霆出手與寬和處置並行，殺伐果斷與寬仁大度兼具。朝野上下、地方郡縣、軍中宮內，所有胡亥殘餘隱秘勢力，被一網打盡，再無任何潛藏的暗流，徹底斷絕了胡亥東山再起的所有可能。
與此同時，贏璃藉此次清查，順勢完善了內外情報監察體系，徹底理順了黑冰臺與錦衣衛的權責分工。
他正式下旨，明確兩大機構的職責邊界：黑冰臺專司境外細作、六國舊貴、邊關異動、江湖勢力監控，負責對外情報、隱秘策反、邊境暗戰；錦衣衛專司朝堂百官、地方官吏、宮內安危、京城治安監察，負責對內肅清、官員監察、京城維穩。
兩大機構互不統屬、相互制衡，直接聽命於贏璃一人，所有情報、證據、密報，皆繞開三公九卿，直達太子案頭，由贏璃親自把控、決斷，杜絕了情報截留、官員干預、徇私枉法之弊。贏璃不再單純依靠下屬上報，而是親自梳理情報脈絡，分析四方動向，對朝野內外、邊境內外的大小事宜，真正做到了“眼觀六路、耳聽八方、知微見著、防患未然”。
這，正是帝王心術的核心所在——掌控資訊，方能掌控全域性；掌控隱秘，方能杜絕隱患。
當最後一名胡亥隱秘黨羽被處置、情報監察體系徹底理順、朝野上下再無潛藏暗流之際，贏璃端坐書房，意識深處，那道淡藍色的進度條微微一顫，泛起細碎的光芒，從45%緩緩跳動至46%，穩穩停駐。
這1%的提升，看似微小，卻重若千鈞。它源於贏璃徹底清除皇室內亂隱患、建立起完備的情報監察網路，讓皇權的觸角，延伸至朝野每一處隱秘角落，實現了對全國上下的全方位、無死角掌控，為後續推行新政、穩固朝政、震懾外患，奠定了最堅實的基礎。
胡亥一案徹底了結，朝野隱患清除殆盡，大秦朝堂的勢力格局，也隨之悄然發生翻天覆地的變化，形成了三足鼎立的全新格局。
其一，老勳貴集團：以李斯、馮劫等開國功勳、宗室老臣為首，歷經此次謀逆案的清洗與震懾，徹底收斂鋒芒，再也不敢有半分輕視之心，對贏璃唯命是從，只求安享尊榮、保全家族；
其二，心腹重臣集團：以蕭何、張良、陳平、韓信為首，皆是贏璃一手提拔、忠心耿耿的心腹，在平亂、護駕、清剿餘孽中屢立奇功，權勢日漸鼎盛，朝堂話語權愈發加重；
其三，關東新銳官吏集團：以贏璃從關東寒門、軍中基層提拔的年輕官吏為主，這群人無背景、無派系，只忠於太子，敢想敢幹，全力推行新政，逐步佔據朝堂民政、農耕、水利等關鍵職位。
三方勢力，各有優劣，各有立場，看似平穩，實則暗藏矛盾與博弈：老勳貴集團資歷深厚，固守祖制，打心底裡覺得新銳官吏資歷淺薄、不堪大用，不願與其共事，甚至暗中阻撓新政推行；新銳官吏心懷壯志，銳意進取，覺得老勳貴集團迂腐守舊、尸位素餐，阻礙大秦變革，對其頗有不滿；心腹重臣集團夾在中間，雖能居中調和，卻也難免被兩方猜忌，稍有不慎，便會陷入派系之爭。
贏璃冷眼旁觀，將三方勢力的矛盾與博弈，盡收眼底。他深諳“和而不同、制衡共生”的帝王之道，深知朝堂派系之爭，是動搖國本的最大隱患，而派系之爭的根源，從來不是政見不同，而是權責不清、利益不均、互不認可、缺乏敬畏。
他沒有像以往那般，以雷霆手段強行壓制任何一方，也沒有偏袒心腹、打壓老臣、縱容新銳，而是以高超的帝王心術，精準調和、步步為營，重新梳理朝堂權責、分配朝堂利益、固化制衡格局，讓三方勢力從相互敵視、相互博弈，轉變為相互依存、相互監督、齊心輔政，徹底築牢皇權中樞的根基。
秦朝朝堂，以三公九卿為核心架構，丞相總領政務，太尉掌軍事，御史大夫掌監察，九卿分掌具體事務，可此前權責劃分模糊，重疊交叉之處甚多，極易引發派系推諉、爭權奪利。