李世民聽了秦瓊的叫喊，連忙問道：“秦將軍，要留何人？”
秦瓊於李家有恩，武功高強，為人忠厚重情重義，自然受到了李世民的尊重。如今見秦瓊高呼要刀下留人，他不知道秦瓊要保護何人，連忙讓他說是要留何人。
秦瓊見李世民問起，便把單雄信以往呵護自己，與自己情同手足一事與秦王李世民說了。並說單雄信哥哥當年被李淵誤殺，這才不肯降唐的緣由說了。
李世民聽了大為感慨，不禁為單雄信仗義所折服，召喚手下押單雄信上來，和顏悅色地對單雄通道：“單將軍，往日你我各自為戰，所謂過節並非無解。你兄長之事，秦瓊秦將軍已與我說起，希望單將軍能諒解我父皇當年惶恐，以為你兄長是隋煬帝楊堅派來的殺手，才有的誤殺，事出有因，希望單將軍要見諒。”
單雄信聽了不以為然，昂然道：“要殺便殺，我不會降你殺我兄長之唐軍。”
秦瓊和徐茂公等人紛紛勸導單雄信，不要固執己見，單兄長被誤殺，李公也是多有愧疚，至今還念念不忘不知如何彌補的。
“單將軍，今日秦將軍來阻止本王殺你，一是他感恩念舊，二是你我為敵事出有因。本王愛惜你是將才，也希望你能歸順於我，這樣我們共同開創救萬民於水火之中，還民眾一個太平盛世不好豈不更好？”李世民真誠地勸說著。
單雄信就是不降，無論秦瓊和程咬金等人如何勸說，只是喊叫李世民趕緊殺了他。
李世民對於當初那個差點殺掉他的單雄信，自然記憶猶新。本想一殺了之，徐茂公求情網開一面，秦瓊和程咬金等人與單雄信深情厚意，也紛紛前來求情。加上自己父親李淵欠他單家一條人命，李世民便道：“單將軍，你曾差點殺我，本不欲放過你，以免放虎歸山。怎奈眾將軍紛紛求情，我父皇又欠你單家兄長一條人命，今我還你一條人命，放你歸莊，希望你今後不與我李唐為敵，我們從此不用再陣前交鋒。”
“如若今後再次被擒，再無第二次可能，望單將軍自行掂量，莫再逆天行事。你如能答應本王今後不再與李唐為敵，王世充之女王玄瓊你也可以帶走，回莊安享天倫之樂去吧。”李世民見徐茂公和秦瓊等人苦苦哀求相勸，心中不免有所打動，愛將之心不禁油然而生。李世民好事做到底，仁至義盡，便要放了單雄信一條生路。
秦瓊等人聽了，紛紛說秦王李世民真是仁君，能體恤下屬之情義，給單雄信一條生路，紛紛勸說著單雄信答應。
單雄信本欲殺身成仁，一聽他還能帶走妻子王玄瓊，心才有所動搖。
“王世充投降，我也應允他可以不死。單將軍莫非還懷疑我的誠意不成？”秦王李世民見單雄信不信，有所猶豫，便接著說了一句。
單雄信這才徹底放下死心，拱手跟李世民說道：“謝謝秦王不殺，一命抵一命，你我兩家從此不再相欠。你既然能給予我夫人王玄瓊一條活路，那是我單雄信欠你了。我單雄信頂天立地，從不食言，在此承諾，從此我就不再出莊與李唐為敵。”
秦瓊等人聽了大喜，連忙拜謝秦王李世民不殺單雄信之恩，拿了中軍令就去把王玄瓊提了出來，交與單雄信。
秦瓊、程咬金和徐茂公等人也不便宴請單雄信送別，便準備了一些乾糧和銀兩，把他夫妻送上了回家之路，到十里長亭之外，才相互依依惜別。
那單雄信回莊之後，果然信守諾言，不再出莊，自此和王玄瓊一起隱身埋名，低調生活，對上門來邀請的各路人馬，不再見面受邀。
秦王李世民班師凱旋，他親自披掛黃金鎧甲，排列一萬騎兵，穿鎧甲士兵三萬人，前後部都敲鼓吹號，在太廟貢獻俘虜的二偽主竇建德、王世充以及隋朝器物車乘。唐皇李淵認為自古以來舊的官階與特殊功勞不相稱，於是另外發徽號，以表彰李世民的功勳德望。十月，加李世民天策上將封號、陝東道大行臺，位在王公之上。增加食邑二萬戶，連以前的共計三萬戶。賜給金車一輛，王公之袞衣和冠冕一套，玉璧一雙，黃金六十斤，前後部鼓吹及九部之樂，儀仗四十人。
這時海內漸漸太平，秦王李世民於是專心一意讀經史子集，開文學館以接待四方才學之士。行臺司勳郎中杜如晦等十八人為學士，每次在閣下輪流值班。秦王李世民則降低身份以溫和的態度經常與學士們討論經義，有時談論到半夜才結束回府，贏得了一片讚譽。
不久，竇建德舊部劉黑闥在相州自稱漢東王，建年號為天造，任命範願為左僕射，董康買為兵部尚書，高雅賢為右將軍，將竇建德的夏政權文武官員全部恢復了原職，定都在洺州。他建立了法規主持政務，全部效法竇建德夏政權的那一套制度。
秦王李世民率軍討伐劉黑闥，軍隊駐紮在衛州。劉黑闥驍勇善戰，詭計多端，多次派兵前來挑戰，都被唐軍程咬金和秦瓊他們打敗，軍心開始挫敗。
劉黑闥內心這才開始有點害怕，放棄了相州，撤退到列人營設防守衛。
這時有洺水縣的人前來拜會劉黑闥當內應，李世民派遣總管羅士信進城據守，沒料到城內奸細眾多，劉黑闥隨後攻克了洺水縣城，羅士信遂不及防，被奸細誅殺陣亡。劉黑闥於是聲勢大漲，據守了洺州。
李唐部隊隨後進軍肥鄉，李世民派程咬金分兵斷絕劉黑闥運糧的通道，雙方開始對峙了兩個月。劉黑闥被迫急於求戰，率領步兵、騎兵二萬人，南渡洺水，迫近李唐軍隊。秦王李世民親自率領精銳騎兵，攻擊劉黑闥的騎兵，攻破了他，乘勝衝擊踐踏他的步兵。劉黑闥開始崩潰，被斬首級一萬多。
先前李世民已派秦瓊築壩堵塞洺水上流使水流變淺，讓劉黑闥得以渡水前來。等到兩軍作戰之時，李世民命令挖開攔河壩，等那大水衝到，有一丈多深，劉黑闥已經戰敗，逃到半路被大水淹死了大多。劉黑闥與二百多騎兵往北逃到突厥，李世民則全部俘虜了劉黑闥的部眾，河北就此被平定了。
當時還有其他叛亂部隊徐圓朗帶兵在徐、兗二州想阻礙秦王李世民，跟劉黑闥前後夾擊想殺李世民措手不及。
李世民回師之時討伐平定了徐圓朗，於是河、濟、江、淮所有州郡城鎮都被李世民平定。
唐皇李淵聽了大喜，加授李世民為左右十二衛大將軍。