然而，就在研究室各項工作剛剛步入正軌，內部凝聚力不斷提升之際，外部的波瀾再次以更迅猛、更出人意料的方式襲來。這一次，不再是針對專案本身，而是直指專案的核心人物——凌風。
一封蓋著“群眾來信”紅色印章、署名“部分知情職工”的舉報信，被直接寄到了省紀委、省衛生廳紀檢組、地區紀委等多個部門。舉報信洋洋灑灑數千字，列舉了凌風“四大罪狀”：一、利用重點專案負責人的職權，在研究室裝置採購、試劑購買中“收受回扣”、“中飽私囊”，並列舉了幾筆看似有問題的採購專案和價格對比；二、在專案經費使用中“巧立名目”、“虛報冒領”，特別是人員補助和差旅費報銷“存在嚴重問題”；三、生活作風“腐化”，與本院女醫生蘇青“關係曖昧”，利用職權為其“謀取私利”（如破格晉升、安排其妹妹工作）；四、在專案對外合作中“搞小圈子”、“排斥異己”，將重大國際合作機會“私相授受”給關係密切的劉教授，損害醫院和國家利益。
舉報信內容詳實，有具體時間、事件、金額（雖然大多扭曲或斷章取義），殺傷力極強。更厲害的是，信中還附了幾張模糊的照片影印件，一張是凌風和蘇青某次下班後並肩走在回宿舍路上的背影（看似親密），一張是凌風與一個西裝革履的男人（疑似裝置供應商）在飯店門口握手的照片，還有一張是研究室裝置採購清單的區域性，上面有幾個手寫的數字和問號，暗示價格虛高。
這封信如同一顆重磅炸彈，瞬間在地區和省裡相關部門引起了軒然大波！經濟問題、作風問題、以權謀私……每一項都是高壓線，尤其是在重點專案剛剛獲批、備受關注的敏感時期！
省衛生廳紀檢組和地區紀委迅速組成聯合調查組，第一時間進駐青山醫院，宣佈對舉報信反映的問題進行“初步核實”，要求醫院全力配合，並“建議”凌風在調查期間，“暫停履行研究室主任及重點專案負責人職務”，“配合調查”。
訊息傳來，如同晴天霹靂，將剛剛因研究室成立而士氣高漲的醫院再次打入冰窟。李院長氣得臉色鐵青，在辦公室拍著桌子大罵“無恥之尤”、“血口噴人”！蘇青聽到“生活作風”的指控，又氣又急，臉色蒼白，身體微微發抖。老周、趙曉燕等人更是義憤填膺，紛紛表示要去找調查組說清楚。
凌風反而是最平靜的一個。當調查組負責人、省廳紀檢組一位姓何的副處長向他宣佈“暫停職務”的決定時，他面色如常，只是點了點頭，說了句：“我接受組織決定，會積極配合調查。清者自清。”
他回到自己的辦公室（暫時被要求不得進入研究室），開始整理自己經手的所有專案經費賬目、採購合同、審批記錄、報銷票據，以及與合作方（劉教授、戴維教授）的所有往來信函、會議紀要。每一筆款項，每一次決策，他都留有清晰記錄。蘇青的晉升，完全符合程式，有院黨委會和職稱評審委員會的記錄；安排凌雨工作，是正常的人事分配流程，有地區衛生局的批覆函。至於那些照片，他稍一回憶就能說清時間地點人物。
他知道，這是對手的又一次瘋狂反撲，而且手段更加卑劣，直接攻擊他個人，意圖從根本上摧毀專案的領導核心，進而攪亂整個團隊，甚至讓重點專案夭折。這次舉報，顯然經過了精心策劃和長時間的準備，那些扭曲的事實和刻意擷取的照片，說明對方對他們的日常工作甚至生活都有細緻的窺探。
調查迅速展開。調查組查閱賬目、合同，詢問相關人員，包括李院長、蘇青、老周、趙曉燕、小徐，甚至裝置供應商和飯店老闆。凌風被多次單獨談話，要求就舉報信中的每一點指控做出詳細說明和提供證據。
壓力空前巨大。醫院裡流言再起，人心浮動。有人替凌風抱不平，有人私下議論“無風不起浪”，更有人擔心專案會不會因此受到牽連，好不容易爭取來的重點支援會不會被收回。
然而，讓暗中策劃者沒想到的是，這次惡意的舉報，非但沒有擊垮凌風，反而在嚴酷的調查中，意外地檢驗和彰顯了凌風及整個團隊的清白與規範。
賬目清晰，票據齊全，每一筆採購都有比價記錄和集體決策痕跡，價格在當時的市場條件下完全合理。人員補助和差旅費報銷嚴格按標準，簽字齊全。調查組甚至暗訪了那幾個裝置供應商和飯店，證實都是正常的業務往來和私人聚餐（慶祝研究室成立），並無任何不當交易。
蘇青的晉升材料完整，程式合規，其業務能力和貢獻有目共睹。凌雨的分配手續齊全。與劉教授的合作基於長期的學術友誼和共同的科研目標，與戴維教授的合作更是經過醫院、學校層層報批和專家論證，程式公開透明。
至於那些照片，凌風坦然解釋：與蘇青同行是日常工作交流，醫院許多同事都可作證；與供應商握手是正常的商務禮節；採購清單上的手寫數字是他當時核對時做的備註，並非“問題標記”。
調查進行了近十天。這十天，對凌風和整個團隊來說是煎熬，但也是淬鍊。他們沒有停止工作，研究室在小徐和趙曉燕的主持下，實驗照常進行；臨床工作在蘇青和其他醫生努力下，井然有序。大家用沉默而堅定的實際行動，表達對凌風的信任和支援。
第十一天，聯合調查組召開醫院中層以上幹部會議，何副處長代表調查組宣佈初步核查結果：“經調查，舉報信反映的關於凌風同志的經濟問題、作風問題、以權謀私及合作不公等問題，均查無實據。青山醫院神經疾病中醫藥研究室的專案經費管理規範，採購程式合規，凌風同志及專案團隊成員在工作中勤勉盡責，廉潔自律。調查期間，醫院及專案組工作保持穩定，展現了良好的風貌。對於匿名誣告、陷害同志的行為，我們將按有關規定處理。凌風同志暫停職務的決定予以撤銷，即日起恢復履行全部職責。”
結果宣佈，會議室裡先是一片寂靜，隨即爆發出熱烈的掌聲！許多人眼眶溼潤，李院長更是激動地站起來，緊緊握住何副處長的手，連聲道謝。