琉璃市的危機解除後，短暫的休整期結束。為了響應烈空坐的指引，也為了送瑪納霏回家，眾人來到了琉璃市的軍用碼頭。
停泊在那裡的，不是普通的船隻，而是一艘充滿未來感的流線型銀白色遊艇。
“哇——！！這也太帥了吧！”
小勝趴在欄杆上，眼睛裡全是星星，“這是德文公司最新型的雙核動力水翼船——‘藍湖二號’！據說還搭載了反潛聲吶和自動防禦系統！大吾先生說是送給我們的謝禮！”
“不愧是大吾先生，出手就是大方。”小剛感嘆道，然後看了一眼正被一群君莎小姐圍著簽名的米可利，“米可利先生也很忙啊，居然沒空來送行。”
“好啦，大家快上船吧！”
小智站在甲板上，懷裡抱著瑪納霏，向大家招手。
此時的他，換上了一身清爽的藍白色短袖衛衣，看起來意氣風發。
“瑪納！瑪納！”（出發！出發！）
瑪納霏在小智懷裡開心地揮舞著觸角，它似乎很喜歡海風的味道，那種回家的感覺讓它異常興奮。
“來了！”
小遙提著那個特製的恆溫水囊（雖然瑪納霏已經孵化，但它還是喜歡睡在裡面），快步跑上了船。
隨著引擎的低鳴，藍湖二號切開波浪，駛向了烈空坐指引的茫茫大海。
航行了大約兩小時，四周已是一望無際的碧海藍天。
甲板上，眾人正在享受難得的午後陽光。
“瑪納霏，來吃這個！”小遙拿著特製的寶可芬，像喂寶寶一樣餵給瑪納霏。
“瑪納~”（好吃~）
瑪納霏吃完後，立刻游到小智身邊，蹭著他的臉頰撒嬌，發出軟糯的聲音。
“PaPa！”
“哈哈，好癢啊。”小智笑著把它舉高高，讓它去抓空中的長翅鷗。
莎莉娜坐在一旁的太陽椅上，手裡端著一杯果汁，墨鏡下的眼神有些複雜。
她看著這和諧得彷彿“一家三口”的畫面，心裡雖然有點酸，但更多的是一種深深的不安。
從上船開始，她的系統就在瘋狂報警。
【警告！檢測到高維時空殘留物。】
【目標：瑪納霏。】
【分析進度：98%……99%……100%。】
【解析完成。正在構建“來源地”的時間線模型。】
“這是……”
莎莉娜看著眼前突然彈出的全息投影（只有她能看見），手中的果汁杯“啪”的一聲掉在了地上，摔得粉碎。
“莎莉娜？怎麼了？”小智和小遙聽到聲音，連忙跑了過來。
莎莉娜臉色蒼白，摘下墨鏡，眼神中充滿了驚恐。
“小智……小遙……我的系統（因為之前的原因，莎莉娜也沒隱瞞系統的存在，選擇和幾人分享了她有系統這個秘密），解析出了瑪納霏的‘過去’……不，是它的‘未來’。”
“未來？”小智一愣，“你是說，它真的是從未來穿越回來的？”
“不僅如此。”莎莉娜深吸一口氣，手指在虛空中划動，將系統模擬的畫面投影到了眾人的視網膜上（利用系統的共享功能）。
“你們看……這就是瑪納霏原本所在的時間線。”
畫面展開：
那是一個灰暗的世界。
沒有陸地。
曾經繁華的豐緣地區、關都地區、甚至卡洛斯地區，全部消失了。
只有無邊無際的、渾濁的黑色海水，吞沒了一切。
人類只能生活在漂浮的巨大難民船上，在這片死海中苟延殘喘。
而在那片死海的中央，一座破碎的神殿正在沉沒，失去了光澤的“王冠”沉入深淵。
【系統推演結論：海之神殿“亞克夏”因為核心“海之王冠”枯竭而沉沒，導致全球洋流系統崩壞，海平面無限制上升。世界被海洋吞沒。】
“這……這是世界末日嗎？”小霞捂住了嘴，身為水系館主，她比誰都清楚這意味著甚麼。
“這就是瑪納霏拼死也要穿越回來的原因。”莎莉娜看著小遙懷裡懵懂的瑪納霏，聲音顫抖，“它是那個絕望未來的最後希望。它穿越時空，就是為了在‘海之王冠’枯竭之前，用它的力量去修復它，改變這個結局。”
全場死寂。
小遙緊緊抱住瑪納霏，眼淚奪眶而出：“原來……你揹負著這麼沉重的使命嗎？在這個小小的身體裡……”
“瑪納？”瑪納霏歪了歪頭，顯然聽不懂太複雜的話，只是感受到“媽媽”的難過，伸出小手摸了摸小遙的頭。
“放心吧。”
一隻溫暖的手覆蓋在了小遙的手背上。
小智握住了小遙和瑪納霏的手，眼神中燃燒著前所未有的火焰。
“既然它叫我一聲爸爸，那我就負責把那個甚麼王冠修好。”
小智看向那片全息投影中的絕望大海，語氣堅定得如同磐石。
“不管那個未來多麼可怕，既然我們知道了，就絕對不會讓它發生！”
就在眾人沉浸在震驚與決心中的時候。
“啪、啪、啪。”
一陣清脆的掌聲從船頂的雷達架上傳來。
“精彩。真是精彩。”
一道矯健的身影從高處翻身跳下，穩穩落在甲板上。
那是一個穿著狂野的無袖背心、留著綠色頭髮、手裡拿著一個奇怪陀螺裝置的男人。
“本來我還想故弄玄虛一下，給你們講講任務背景。”
男人對著莎莉娜咧嘴一笑，眼神中滿是驚訝，“沒想到這位小姐的情報能力比聯盟的先知還要恐怖。連‘毀滅的時間線’都能推演出來嗎？”
“你是誰？！”小智瞬間護住瑪納霏，皮卡丘臉頰帶電。
“別緊張，自己人。”
男人舉起雙手示意無害，“我是受米可利和大吾委託，來協助你們的寶可夢遊俠——傑克·沃克（。叫我傑克就行。”
“寶可夢遊俠？”小剛驚訝道，“就是那些不使用精靈球，而是透過情感連線，來借用野生寶可夢力量的人？”
“賓果！”傑克打了個響指，看向莎莉娜，“正如這位小姐所說，我們的目標是亞克夏神殿。海盜魅影正在尋找它，企圖奪走‘海之王冠’上的寶石。如果讓他得逞，神殿就會沉沒，你們看到的那個地獄般的未來……就會成真（並不知道系統的存在，只當莎莉娜是個擁有預知能力的超能力者）。”
傑克走到小智面前，看著他懷裡的瑪納霏。
“蒼海的王子選擇了你作為父親，這在歷史上還是頭一次。小智，你的波導……很特別。”
就在傑克準備詳細說明作戰計劃時。
轟隆！！
藍湖二號劇烈搖晃，警報聲大作。
“敵襲？！”小智衝出船艙。
只見遊艇的周圍，不知何時浮出了十幾艘小型的武裝潛艇。
而在正前方，一艘如同移動堡壘般的巨型潛艇破水而出，遮蔽了陽光。巨大的機械臂上印著海盜的骷髏標誌。
潛艇的甲板上，站著一個身材高大、戴著面具、披著紅色披風的男人。
海盜魅影。
“哈哈哈哈！終於找到你了，蒼海的王子！”
魅影的聲音經過擴音器，顯得格外刺耳，“還有那個傳說中打敗了神的少年！我知道你們要去神殿！把瑪納霏交出來！它是解開封印的鑰匙！”
“為了那種自私的理由，就要毀滅世界嗎？”莎莉娜憤怒地喊道。
“世界？哼，只要擁有了‘海之王冠’，我就是世界的新神！到時候我想造甚麼世界都可以！”
魅影舉起右手，他的手套上散發著詭異的紫色電流。
那不是精靈球，而是強行控制裝置。
“上吧！我的奴僕們！”
魅影一揮手。
轟！轟！轟！
海面炸開，無數只雙眼通紅、顯然被洗腦控制的毒刺水母和巨牙鯊從水中躍出，撲向藍湖二號。
“皮卡丘！十萬伏特！”
“龍蝦小兵！泡沫光線！”
小智和眾人在甲板上展開了反擊。
傑克也甩動捕獵遊標，畫出一個光圈：“借用一下力量吧！長翅鷗們，起風！”
但敵人的數量太多了。而且那艘巨型潛艇的主炮正在充能，目標直指瑪納霏。
“該死，數量太多了！”傑克咬牙，“我的遊標一次只能安撫幾隻！”
“瑪納！！”
看著大家陷入苦戰，小智懷裡的瑪納霏突然掙脫出來，飛到了半空中。
它不想看到爸爸媽媽受傷。
它感受到了小智心中那股強烈的、想要保護大家的波導。
它頭頂的觸角發出了刺目的紅光。
特有絕招——心靈交換！
“小智！把你的波導借給它！”莎莉娜大喊，“它想把你的心意傳達出去！”
“好！”小智閉上眼，藍色的波導爆發，與瑪納霏的紅光連線在一起。
“聽好了大家！快醒醒！！”
嗡——！
一道無形的波紋以瑪納霏為中心，瞬間掃過全場。
下一秒，奇蹟發生了。
原本那些雙眼通紅、瘋狂攻擊的毒刺水母和巨牙鯊，動作突然停滯了。
它們眼中的紅光消退，取而代之的是迷茫，以及……一絲溫暖。
它們感受到了小智的波導——那種純粹的、想要守護生命的心意。
魅影的洗腦控制，被這股溫暖的波導強行衝散了！
“甚麼？！”魅影大驚，“竟然解除了我的精神枷鎖？！這怎麼可能！”
“幹得漂亮！！瑪納霏”小智大喊，一把接住力竭落下的瑪納霏。
“皮卡丘！趁現在！伏特攻擊！！”
皮卡丘化作金色流星，踩著那些恢復理智、主動搭起“橋樑”的毒刺水母的頭頂，一路衝向魅影的潛艇。
轟！
一擊命中潛艇的指揮塔。
“可惡！撤退！先撤退！”
魅影看著失控的場面，只能咬牙下令潛入深海，“反正神殿的位置我已經知道了！我們在亞克夏見！”
擊退海盜後，眾人都鬆了一口氣。
傑克看著小智，眼中滿是震驚：“利用瑪納霏的能力，將自己的波導擴散到整個戰場……小智，你簡直就是天生的‘遊俠’。”
“嘿嘿，是嗎？”小智撓了撓頭，“我只是不想讓它們被控制而已。”
莎莉娜看著系統面板，原本那個紅色的“世界末日”倒計時，似乎稍微減慢了一點點。
“未來……真的在改變。”莎莉娜喃喃自語。
傑克指著前方一片被濃霧籠罩的海域。
“穿過這片迷霧，就是亞克夏神殿的所在地了。那是隻有滿月之夜才會浮出水面的奇蹟之地。”
此時，夜幕降臨。
一輪巨大的滿月懸掛在海平面上。
小智走到船頭，懷裡抱著瑪納霏，身邊站著小遙。
他看著那片迷霧，眼神堅定。
“走吧。”
“去解開最後的謎題，去拯救那個被淹沒的未來。”
藍湖二號引擎全開，衝進了迷霧之中。
在那迷霧的深處，一座宏偉的水晶宮殿，正在月光下若隱若現。
【莎莉娜立大功！系統流的正確用法：劇透未來！】
【傑克：本來我是來裝酷的，結果被莎莉娜和小智搶了風頭。】
【那個被淹沒的未來……有點像《未來水世界》啊，細思極恐。】
【瑪納霏+小智=全圖淨化掛。魅影要哭了。】