黑暗之門的能量節點被摧毀後，宇宙同盟獲得了短暫的喘息機會。林風返回中樞塔，與蘇沐雪等人匯合，討論接下來的應對之策。蘇沐雪將最新研發的科技武器投影在大屏上，這是結合了修真本源能量和機械技術的“萬靈戰艦”，艦身由巖魔族提供的特殊礦石煉製，能夠吸收周圍的本源能量，艦首的主炮可以發射融合混沌、靈曦、雷澤三種能量的超級光束。
目前已經量產了一百艘萬靈戰艦，分佈在各個星域的防線。蘇沐雪說道，這種戰艦的威力遠超之前的機械戰艦，能夠有效剋制黑暗能量，而且船員可以透過體內的本源能量與戰艦形成共鳴，發揮出更強的戰力。
林風點頭，立刻下令將萬靈戰艦部署到黑暗之門前線。與此同時，西部星域的巖魔族傳來訊息，他們發現了一處上古礦脈，礦脈中蘊含著大量的“本源礦石”，能夠進一步提升萬靈戰艦的效能。蕭辰主動請纓，率領工程艦隊前往礦脈開採，同時護送礦石返回總部。
蕭辰的艦隊抵達西部星域時，發現礦脈周圍已經出現了少量黑影戰士的蹤跡。這些黑影戰士似乎是專門來阻止礦石開採的，數量雖然不多，但實力都達到了大乘期初期。蕭辰沒有絲毫猶豫，下令萬靈戰艦展開攻擊。
艦首的主炮亮起三色光芒，超級光束如同利劍般射向黑影戰士。黑影戰士試圖用黑暗能量抵擋，卻被光束瞬間穿透，身體化為灰燼。剩餘的黑影戰士見狀，紛紛四散奔逃，蕭辰下令艦隊追擊，將其徹底清理。
開採工作順利進行，巖魔族的礦工們駕駛著採礦機器人，深入礦脈挖掘本源礦石。礦石剛被開採出來，就散發著濃郁的本源能量，與萬靈戰艦的能量系統產生共鳴。蕭辰將第一批礦石送往總部，蘇沐雪的科研團隊立刻開始升級萬靈戰艦。
升級後的萬靈戰艦，主炮威力提升了三成，防禦能力也大幅增強，還新增了“本源護盾”，能夠自動吸收黑暗能量轉化為自身動力。林風親自試駕了升級後的戰艦，感受到其強大的效能，心中更加有底。
就在此時，黑暗裂縫深處傳來異動，噬界之主的氣息變得越來越強烈，黑暗之門的周圍再次聚集了大量的黑影戰士，而且出現了許多體型龐大的黑暗巨獸。這些巨獸高達數十丈，周身覆蓋著厚厚的黑色鱗片，能夠噴吐黑暗火球，威力無窮。
林風下令萬靈戰艦編隊出擊，一百艘戰艦組成楔形陣，朝著黑暗巨獸衝去。戰艦的主炮同時發射，三色光束交織成網，將數只黑暗巨獸籠罩。黑暗巨獸的鱗片雖然堅硬，但在超級光束的攻擊下，還是出現了裂痕，發出痛苦的嘶吼。
阿炎率領淨化部隊配合戰艦攻擊，靈火能量與光束結合，形成火焰風暴，灼燒著黑暗巨獸的傷口。水域族的修士釋放出大量水流，將黑暗火球撲滅，同時淨化被汙染的區域。凌雲的空間小隊則潛入黑暗巨獸群中，用空間之刃攻擊它們的眼睛等薄弱部位。
激戰持續了整整一天，萬靈戰艦展現出了強大的戰力，共斬殺了三十多隻黑暗巨獸，殘餘的黑影戰士和巨獸再次退回黑暗之門內。這場戰鬥讓宇宙同盟計程車氣大振，也證明了科技與修真結合的可行性，為後續的戰鬥積累了寶貴的經驗。
林風知道，這只是噬界之主的試探性攻擊，真正的大戰還在後面。他下令加快本源礦石的開採速度，繼續升級萬靈戰艦，同時讓各種族加強修煉，提升自身實力。宇宙同盟的備戰工作，進入了更加緊張的階段