共生探索艦全速駛向始祖神殿，星諾利用這段時間，向眾人講解了失衡大陣的破解之法與淨化始祖的計劃：“失衡大陣的核心是三座‘失衡能量塔’，分佈在始祖神殿的東、西、南三個方向，塔內的失衡能量驅動著整個大陣。我們兵分四路，星穹長老帶領三名戰士，摧毀東部的能量塔；另外兩名維度戰士和兩名次元戰士，分別摧毀西部和南部的能量塔；我獨自前往神殿中央，牽制寂滅始祖與寂滅古主，等大陣破解後，再用共生本源之力淨化始祖的失衡本源。”
“星諾大人，讓我跟你一起去中央戰場！”一名次元戰士主動請纓，“寂滅始祖和寂滅古主的實力太強，你獨自前往太危險了！”
星諾搖了搖頭：“中央戰場的失衡能量最濃郁，只有我覺醒的共生本源之力能抵禦。你們的任務是儘快破解大陣，這是整個計劃的關鍵，不能有任何失誤。”
眾人深知事態緊急，不再勸阻，各自做好戰鬥準備。一天後，共生探索艦抵達始祖神殿外圍，玄次元帶領留守的聯盟成員前來接應，眾人匯合後，立刻按照計劃展開行動。
此時的始祖神殿，封印的七彩光芒已經變得極其微弱，寂滅古主帶領剩餘的寂滅戰士，正在瘋狂攻擊封印，黑色的寂滅能量不斷衝擊著封印屏障，屏障上的裂痕越來越多。寂滅始祖的身影在封印中愈發清晰，他的眉心處，一顆黑色的“失衡核心”散發著強烈的能量波動，正是始祖本源核心。
“星諾，你果然沒死！”寂滅古主看到星諾，眼中閃過一絲殺意，“既然送上門來，今天就一併解決你，為我的族人報仇！”
星諾手持共生本源劍，飛身衝向神殿中央：“寂滅古主，你的對手是我！”她揮動長劍，釋放出一道七彩本源斬，朝著寂滅古主襲來。寂滅古主不敢大意，揮動寂滅古刃抵擋，兩道能量碰撞，寂滅古主被震退數步，臉色凝重：“共生本源之力？你竟然獲得了傳承！”
與此同時，星穹帶領小隊抵達東部的失衡能量塔。能量塔高達百米，通體由黑色岩石構成，表面刻滿了失衡符文，塔頂釋放著黑色的失衡能量，匯入神殿中央的大陣中。塔的周圍，駐守著數十名寂滅戰士，為首的是一名倖存的寂滅長老。
“想要破壞能量塔？痴心妄想！”寂滅長老手持寂滅法杖，釋放出寂滅火雨，朝著星穹小隊襲來。星穹帶領戰士們釋放共生合擊技，七彩能量束擊碎了火雨，同時發起反擊，雙生能量刃與次元平衡矛配合，很快便突破了寂滅戰士的防線，朝著能量塔衝去。
西部和南部的能量塔戰場也同時打響，聯盟戰士們憑藉著共生能量的優勢，與寂滅戰士展開激戰。星諾則與寂滅古主纏鬥在一起，共生本源劍的每一次攻擊，都能淨化大量的寂滅能量，讓寂滅古主疲於奔命。
“始祖，快甦醒吧！”寂滅古主大喊，朝著封印中的寂滅始祖傳遞能量。寂滅始祖的身體劇烈蠕動，石衡核心的光芒越來越亮，封印屏障的裂痕迅速擴大，眼看就要徹底破碎。
星諾心中焦急，加快了攻擊節奏，共生本源劍釋放出更強的本源之力，一劍刺穿了寂滅古主的肩膀。寂滅古主慘叫一聲，體內的寂滅能量大量流失，卻依舊死死纏住星諾，為始祖的甦醒爭取時間。
就在這時，通訊器傳來星穹的聲音：“東部能量塔已摧毀！”緊接著，西部和南部的能量塔也相繼被摧毀。三座能量塔被毀，失衡大陣的能量瞬間減弱，神殿中央的黑色能量場開始消散，空間扭曲的現象也逐漸停止。
“不好！”寂滅古主臉色大變，他知道，失去大陣的保護，寂滅始祖將直接暴露在共生本源之力的攻擊下。
封印屏障徹底破碎，寂滅始祖完全甦醒，他伸展著巨大的身軀，失衡核心散發著令人窒息的能量波動，眼中閃過一絲冰冷的殺意：“共生本源？終於再次見面了。千萬年前未能吞噬你，今天，我將完成這個夙願！”
他揮動巨大的手掌，朝著星諾拍來，手掌所到之處，空間被徹底湮滅，只剩下純粹的失衡能量。星諾不敢大意，催動共生本源戰甲，將共生本源劍的能量發揮到極致，一道巨大的七彩本源斬朝著始祖的手掌劈去。
“轟！”能量碰撞的瞬間，巨大的衝擊波席捲整個始祖神殿，無數岩石崩塌，寂滅戰士們被衝擊波吞噬，瞬間化為虛無。星穹帶領眾人迅速撤離到神殿外圍，遠遠觀望中央戰場的戰況。
星諾被衝擊波震退數千米，嘴角溢位金色的鮮血，共生本源戰甲出現了一道細微的裂痕。寂滅始祖的手掌也被本源斬劃傷，黑色的血液滴落，落在地面上，腐蝕出一個個深坑。
“沒想到，覺醒後的共生本源竟有如此力量，”寂滅始祖眼中閃過一絲驚訝，隨即化為更強的殺意，“但這還不夠！失衡之力，吞噬天地！”
他催動失衡核心，釋放出漫天的失衡能量，這些能量如同黑色的潮水，朝著星諾湧來，想要將她吞噬。星諾深吸一口氣，將共生本源的力量與跨次元的所有生命印記融合，大喊道：“共生本源，包容萬物，淨化失衡！”
共生本源劍釋放出七彩光芒，形成一道巨大的淨化能量場，將失衡能量牢牢包裹。黑色的失衡能量與七彩的淨化能量相互交織，不斷碰撞、轉化，星諾能感受到，失衡能量正在被逐漸淨化，轉化為共生能量，但這個過程極其艱難，她的體力與能量也在快速消耗。
寂滅古主趁機發起攻擊，寂滅古刃朝著星諾的後背劈來。就在這千鈞一髮之際，一道金色的光流突然從次元平衡通道的方向襲來，擊中了寂滅古主的後背，寂滅古主慘叫一聲，身體被光流貫穿，徹底消散在空氣中。
星諾回頭望去，只見平衡空間站的方向，共生終極炮再次啟動，一道巨大的七彩能量束朝著始祖神殿射來，正是玄次元帶領留守成員，為她提供支援。