尼爾世界的人類，滅亡的要比想象中的還要古早得多。
某種情況來說，尼爾世界的人類，其實在外星生命體入侵地球之前，就已經全部滅絕了。
其滅絕的主要原因，還要從尼爾機械紀元的前作，以及關聯作品說起。
尼爾世界的誕生，源自於遊戲《龍背上的騎兵》的其中一個結局。
身處在另一個異世界的，名為凱姆地少年與他的紅龍夥伴，在最終決戰之前，被傳送門傳送走，離開了異世界，並掉到了接近萬年前的，尼爾機械紀元所在的地球。
名為凱姆地少年與他的紅龍夥伴安吉爾所出現的地點，便是在東京的新宿地區。
在那裡，他們與突然出現的白色巨人戰鬥後，艱難取勝後。
但因為人類不知道他和她的紅龍夥伴是敵是友的情況下，選擇了對他們展開攻擊。
在兩發導彈的攻擊下，凱姆和安吉爾被雙雙擊殺，紅龍安吉爾的屍體也就此被人類繳獲，運走。
但這也為人類的滅亡埋下了伏筆。
紅龍體記憶體在病毒微粒，也被稱為魔素的東西開始擴散，並逐漸演化出了一種席捲全球的絕症，‘白鹽化症候群’。
感染這種病毒的人類，絕大部分會逐漸結晶鹽化，並最終死亡，少部分則是會發狂，並徹底化作魔物！
面對這種可怕的絕症，人類經過研究也最終束手無策。
在危急存亡之際，人類選擇了啟動了所謂的格式塔計劃。
格式塔計劃，就是將全球所有人的靈魂和肉體分離後，儲存在一個名為格式塔的網路中。
並製造了新的人造人軀體後，伴隨著人造人年齡的增長，當肉體和靈魂的年齡吻合時，再將靈魂取出，放到人造人的身軀中，讓人類脫離絕症的困擾，重新繁衍生息。
而格式塔計劃，最終也落在了一個名為尼爾的少年身上。
尼爾天生具有著十分強大的魔素適應性，在研究人員眼中，他是一個十分合適的，維持格式塔運轉的實驗體。
而因為尼爾的妹妹悠那患有絕症，所以，研究人員以答應尼爾冷凍其妹妹千年的條件，讓尼爾資源成為了維持格式塔計劃的核心。
不過，他們並沒有履行諾言，而是在尼爾被抽離靈魂，成為格式塔計劃核心後，也見過悠那的靈魂抽離，放入格式塔內後，並製造了悠那的人造人。
雖然從另一種層面上來講，只要格式塔計劃成功，尼爾的妹妹依舊可以重新復活吧。
但凡事總有意外。
尼爾作為格式塔計劃的核心，維持著全球數十億人靈魂的運轉。
而作為後手，人類製造了雙子人造人，即迪瓦拉和波波拉。
她們作為尼爾人造人軀體的引導者，一直照顧著尼爾人造人軀體的存活。
因為格式塔計劃需要讓所有人類的人造人軀體，全部重新生長到被抽離靈魂時，所有年齡的程度，導致這本就是一個十分漫長的過程。
（其實就是人類被抽靈魂時年齡不一樣，製造的人造人身軀卻是從一歲開始成長的，為了讓所有的人類靈魂都有匹配的人造人軀體，就需要不斷地讓人造人身軀輪迴，直到所有人造人的軀體，都和本體靈魂的年齡吻合，才能夠釋放格式塔的所有靈魂）
（而且雖然都叫人造人，但人工生命裡的是真正的肉體，而機械紀元的就是純機械了，兩者有差別）
但在漫長的相處中，波波拉和迪瓦拉，對人造人狀態的尼爾產生了額外的親情，導致她們已在推後即將到來的，解放格式塔的契機直到……
一種名為黑文病的絕症，開始在人造人群體中肆虐開來。
這是一種預兆，預兆著格式塔計劃的維持著，真正的尼爾已經快要堅持不住了。
而問題也在於，人造人尼爾的妹妹，人造人悠那，也感染了黑文病！
為了解救妹妹，人造人尼爾也踏上了尋找解除黑文病的旅途。
至於接下來的結果就顯而易見了。
為了拯救自己的妹妹，人造人尼爾，在歷經磨難後，知曉格式塔計劃的所有真相，並在面對本體尼爾化作的魔王時，將本體尼爾擊殺了……
作為維持格式塔計劃的載體，尼爾的死亡導致格式塔計劃直接崩毀，裡面維持著的全人類的靈魂也隨之徹底消亡！
至此，尼爾機械紀元的人類文明徹底完蛋。
當最後一個擁有肉體的人造人死亡，尼爾世界的人類，就此徹底消失。
剩下的，就是以機械狀態為主的，人造人還存活在地球之上。
至於再後來的事情就很簡單了，外星生命體入侵地球，人造人舉著人類的大旗開始反抗，與外星生命體制造的機械生命體展開了曠日已久的戰爭。
直到外星生命體被反噬殺死，戰爭卻依然沒有停止。
姬浩負手而立，看著遠處那蔚藍色的地球，也是緩緩開口道。
“無論人類是否存在，這顆星球依舊是這般模樣……”
懷特站在姬浩的身後，靜靜的，等待著姬浩的下一步指令。
“不過，既然我來了，你們也不用一直困守在這方世界，為了那永無止境的戰鬥拼搏了。”
姬浩轉過身，看著懷特，也是緩緩開口道。
他說的倒也沒錯，在這個世界的人造人和機械生命體間的戰爭，本就是無窮無盡，沒有盡頭的。
因為，機械生命體覺醒後，它們已經可以開始思考，並建立了宛如蟲群般的思維網路。
它們明確的知道，如果將所有的人造人消滅，那麼它們就失去了繼續存在的價值。
所以，為了延續機械生命體的存在，它們並沒有對人造人展開滅絕性的攻擊。
可以說，如果雙方達成共識，雙方真能一直打下去。
“不過，我得改一下你們的底層邏輯就是了。”
姬浩看著懷特，也是緩緩開口道。
永遠忠誠於人類的人造人，聽起來固然好聽。
但明顯也有個麻煩，那就是隻要是人類，就可以獲得她們的忠誠。
這就很麻煩了呢。