帝皇龍甲獸的身影劃破日本各地的天空，金色的光芒所過之處，失控的數碼獸紛紛被柔和的能量包裹，化作光點穿過臨時開啟的數碼通道。從北海道的雪原到九州的海岸，不過半小時，所有闖入現實世界的數碼獸都被安全送回了數碼世界。
站在東京塔的頂端，李陽、大輔等人望著恢復秩序的城市，緊繃的神經終於稍稍放鬆。可還沒等他們喘口氣，天空中突然出現了無數道淡藍色的裂隙——全球各地的數碼大門，竟在同一時間開啟了！紐約的自由女神像旁、巴黎的埃菲爾鐵塔頂端、埃及的金字塔上空……都浮現出數碼世界的景象，零星的數碼獸正從裂隙中墜落。
“怎麼會這樣？”嘉兒看著終端上全球同步傳來的畫面，迪路獸的耳朵緊張地豎起。
這時，玄內的聲音透過數碼終端響起，帶著前所未有的凝重：“現實世界與數碼世界的壁壘正在全面崩塌，全球的數碼大門同時開啟，這是黑暗力量最後的反撲。”
“那我們該怎麼辦？”大輔急問。
“能穩定並關閉這些大門的，只有你們手中的D-3暴龍機。”玄內的聲音清晰地傳入每個人耳中，“李陽的基爾獸、多路獸，大輔的V仔獸，小京的麻鷹獸，阿武的巴達獸，伊織的穿山獸，嘉兒的迪路獸，以及太一的亞古獸、阿和的加布獸、光子郎的甲蟲獸、阿丈的哥瑪獸、素娜的比丘獸——你們11個被選中的孩子，必須分頭行動。”
終端螢幕上立刻出現了世界地圖，六個閃爍的紅點標註著需要重點守護的區域：“北美、歐洲、非洲、大洋洲、南美，以及亞洲其他地區。你們要與當地被選中的孩子匯合，用D-3暴龍機的力量引導數碼獸回歸，關閉大門。”
“11個人分成6組嗎？”光子郎迅速分析，“我和太一、阿和去歐洲吧，那裡的數碼大門最密集，需要強大的戰力。”
“那我和素娜、阿丈去非洲。”太一的聲音從終端傳來，亞古獸在他身邊低吼表示贊同。
伊織舉起手：“我想去大洋洲！那裡的島嶼多，我可以讓穿山獸進化成潛鯊獸幫忙！”
“那我和小京一組，去南美怎麼樣？”嘉兒看向小京，迪路獸和麻鷹獸友好地蹭了蹭鼻子。
“沒問題！”小京爽快答應，“亞古拉獸的速度快，剛好適合大範圍搜尋。”
大輔拍了拍胸脯：“那我和小賢去北美！機甲龍獸的力量足夠應付那邊的情況！”
最後，李陽看向阿武：“阿武，我們去亞洲其他地區吧？多路獸擅長偵查，巴達獸進化後能覆蓋更廣的區域。”
阿武點頭：“好！神聖天使獸的天國之門也能幫忙引導數碼獸。”
玄內的聲音再次響起：“記住，D-3暴龍機的力量需要你們與數碼獸心意相通才能完全發揮。當所有大門關閉時，就是黑暗力量徹底消散的時刻。”
11個孩子在數碼終端前相視一笑，儘管即將分別，心中卻充滿了默契的力量。他們知道，此刻的分散是為了最終的團聚。
“出發！”
隨著一聲令下，眾人分別登上前往各地的交通工具。李陽看著窗外飛速倒退的風景，基爾獸趴在他腿上，多路獸則警惕地望著天空的數碼大門。他握緊手中的D-3暴龍機，螢幕上閃爍的光點彷彿是全世界被選中的孩子們共同跳動的心臟。
全球的數碼大門前，一場由無數羈絆連線的守護戰，就此拉開序幕。