南明方面，馬士英、阮大鋮失去了江北諸將的支援，實力大減，江南百姓和士林對其聲討不斷，小皇帝也對其產生了不滿，想要罷免他們的官職。馬士英、阮大鋮惶惶不可終日，只能加緊搜刮民脂民膏，擴充軍備，企圖負隅頑抗。
而四川的張獻忠，得知黑石城勢力日益強大，清廷和南明陷入混亂，心中也開始不安起來。他原本想趁機東出三峽，奪取湖廣，但看到黑石城的軍事實力和新武器的威力，又不敢輕舉妄動，只能在四川境內加緊整軍備戰，同時派遣使者前往黑石城，試探凌風的態度。
凌風對張獻忠的使者採取了虛與委蛇的態度，既不拒絕合作，也不做出具體承諾，只是表示願意與西營保持和平共處的關係，開放邊境貿易。他知道，張獻忠殘暴好殺，絕非善類，日後必然會成為黑石城的敵人，但目前的首要任務是平定江南，消滅清廷，暫時不宜與張獻忠翻臉。
這一日，凌風召集核心成員，召開軍事會議，商議下一步的戰略。
“城主，如今科爾沁部結盟，黃得功、劉澤清歸順，清廷內亂，南明虛弱，正是平定江南，北伐清廷的絕佳時機！”韓衝興奮地說道，“屬下建議，兵分兩路，一路由陳大疤率領水師，從長江口進攻南京；另一路由屬下率領陸軍，從山東北伐，直逼北京！”
陳大疤也附和道：“對啊城主！俺的水師現在有了蒸汽戰船和後裝線膛炮，戰鬥力大增，拿下南京易如反掌！北伐的事，也交給俺一部分水師，從海路進攻遼東，端了韃子的老窩！”
凌風搖了搖頭：“諸位將軍的積極性很好，但目前還不是全面開戰的時候。江南雖然虛弱，但馬士英、阮大鋮還有一定的兵力，南京城防也比較堅固，強攻必然會造成較大的傷亡。清廷雖然內亂，但瘦死的駱駝比馬大，關外還有數萬八旗精銳，貿然北伐，風險很大。”
他頓了頓，繼續說道：“我的計劃是，先平定江南，再北伐清廷。平定江南，我們採取‘圍而不攻’的策略，用水師封鎖長江，切斷南京的糧道和外援；用黃得功、劉澤清的部隊，牽制南明的兵力；同時，繼續在江南散播馬士英的罪行，煽動百姓和士兵起義，讓南京不攻自破。等到江南平定後，我們整合江南的資源，再集中兵力，北伐清廷，一舉將其消滅。”
劉文泰贊同道：“城主的計劃非常穩妥。圍而不攻，既能減少傷亡，又能儲存實力，還能讓江南百姓看清馬士英的真面目，可謂一舉多得。”
老拐也補充道：“暗影已經在江南佈置了大量的暗樁，只要城主下令，我們可以立刻煽動百姓和士兵起義，配合大軍行動。”
“好！就這麼定了！”凌風拍板決定，“陳大疤，你率領水師，封鎖長江口，切斷南京與外界的聯絡，同時威懾南明水師，不準其隨意調動；黃得功、劉澤清，你們率領部隊，駐紮在江北，牽制南明的兵力，一旦南京城內有變，立刻出兵接應；韓衝，你率領部隊，加強山東防線，防備清軍可能的進攻；老拐，你讓暗影的人，在江南加緊活動，煽動百姓和士兵起義；劉文泰，你負責後勤保障，確保糧草、彈藥供應充足。”
“遵命！”眾人齊聲應道，臉上滿是鬥志。
會議結束後，各部隊立刻行動起來。陳大疤率領水師，浩浩蕩蕩地駛向長江口，蒸汽戰船“破浪號”一馬當先，船上的後裝線膛炮閃著寒光，威懾力十足。南明水師看到黑石城的水師陣容，嚇得不敢出戰，只能龜縮在港口內，眼睜睜地看著黑石城的水師封鎖了長江口。
黃得功、劉澤清率領部隊，駐紮在江北的揚州、淮安一帶，與南明的部隊對峙。他們的部隊經過黑石城的整編和訓練，配備了新式武器，戰鬥力大增，南明的部隊根本不敢主動挑釁。
暗影的人在江南各地活動，張貼傳單，散佈謠言，煽動百姓和士兵起義。江南百姓本就對馬士英的統治不滿，加上黑石城的煽動，很快就爆發了多起起義。南京城內計程車兵，看到城外的形勢，也人心浮動，不少士兵開始偷偷逃跑，投靠黑石城或黃得功、劉澤清的部隊。
馬士英、阮大鋮陷入了絕望之中，他們一邊派兵鎮壓起義，一邊向清廷求救，但清廷此時自顧不暇，根本無力支援。南京城的糧道被切斷，糧草日益短缺，士兵們吃不飽飯，士氣低落，逃跑現象越來越嚴重。
凌風站在黑石城的頂樓，看著江南傳來的戰報，臉上露出了笑容。他知道，南京城的陷落，只是時間問題，平定江南，指日可待。
江南的七月，驕陽似火，蟬鳴陣陣。南京城內，卻一片死氣沉沉。街道上行人稀少，店鋪大多關門歇業，只有巡邏計程車兵提著刀，無精打采地走著，臉上滿是疲憊和焦慮。城牆上的旗幟歪歪扭扭，城防工事也無人修繕，曾經繁華的帝都，如今只剩下滿目瘡痍。
馬士英的府邸內，氣氛壓抑得讓人喘不過氣。他坐在太師椅上，臉色蠟黃，雙眼佈滿血絲，幾天幾夜沒有閤眼。桌上的飯菜早已涼透，他卻一口未動，只是不停地喝著悶酒。
“馬公，城外的起義越來越多，蕪湖、常州、蘇州等地都已經失守，起義軍正向南京逼近！”阮大鋮匆匆跑進來，臉上滿是驚慌，“城裡計程車兵也人心浮動，今天又有幾百人逃跑了！糧道被黑石城的水師封鎖，倉庫裡的糧食只夠支撐三天了！”
馬士英猛地將酒杯摔在地上，怒吼道：“廢物！都是廢物！連幾個亂民都鎮壓不了，還當甚麼兵！傳我的命令，誰敢逃跑，格殺勿論！再派人去催糧，就算搶，也要搶回糧食來！”
阮大鋮苦著臉說：“馬公，現在外面到處都是起義軍，根本派不出人去催糧。而且，士兵們已經快要譁變了，再這麼下去，不等起義軍攻城，我們自己就先完了！”
“那你說怎麼辦？”馬士英看著阮大鋮，眼神中充滿了絕望，“難道要我們向凌風那個逆賊投降？”