朱由哲得知濟南城失陷的訊息時正在泰安犒賞有功將士。
阿巴泰連續猛攻了三日，城池未破，清軍損失頗大。
多爾袞以阿巴泰曾立下軍令狀為由要將之斬首示眾，得諸將勸說，才停止。但是也藉此奪了阿濟格兵權，讓他回盛京為努爾哈赤守靈。
用這樣的方法狠狠打擊了不聽話的阿巴泰，同時震懾其他清軍將領，挽救因阿濟格身死而損傷的名聲。
之後，多爾袞改變策略，不再強攻一面，而是將濟南城四面圍住。
依當時匯聚在濟南城下的清軍數量和戰力而言，多爾袞的確可以做到。他下令每次在一面投入部分兵力攻城，而又不斷改變攻城方向。
有時北門，有時南門，有時西門，有時東門。
而每次，多爾袞都令進攻清軍全力進攻，而後續兵力更是嚴陣以待，做好隨時全面攻城的準備，以此不斷嚮明軍施壓。
不知道主攻方向，而感覺每次似乎都要城破，這逼的兵力本就不佔優的明軍只能不斷跑著支援各處。
這種不斷的撕扯持續了半個月，最後無論是兵力，還是身心，城中的明軍都到達了極限。
最後，在多爾袞的傾力一擊下，濟南西門被攻破，清軍殺入城中。
朱大典無力阻止，最後孤身返回了都督府，以前的大明德王府，自焚而死。
據清軍說，朱大典自焚之時，房子裡裝滿了金銀。
大火燒化了金銀，成塊的金銀變成了金水，銀水，流的滿地都是，最後只能用刀劍才能撬下來。
朱由哲對於這種說法當然是下旨極力反駁，說是清軍汙衊。但內心卻覺得，或許是事實。
朱大典不是個完美的將帥，他愛財，愛到了骨子裡。
即使朱由哲三令五申，他依舊不斷貪磨將士軍餉。
但這樣一個愛財之人，最後卻殉國而死，而且是在他本來有機會提前撤離的情況下。
朱由哲只能感慨，人心還真是一件複雜的事物。
最後，朱由哲加封朱大典為太子少保，大明左都督，賜諡號“壯”，意指威武剛烈，死於原野。
在破城後，多爾袞在濟南城中進行了大屠殺。
無論老少，是否投降，盡皆被殺。
多爾袞想透過這樣的方式展示清軍的實力，更是一種威懾，以削減阿濟格兵敗身死帶來的影響。
濟南城破沒多久，朱由哲再次收到壞訊息。
昌平城破。
在李過猛攻，和不斷勸降下，城中有將領主動開啟城門迎順軍入城。
昌平城破十日後，劉芳亮攻破通州，金聲桓率部分輕騎突圍，目前行蹤不明。
京城，徹底淪為了一座孤城。
秋去冬來，天氣愈加寒冷。
在順軍攻取昌平和通州之後，天下人的注意力都看向了京師。
朱由哲是，多爾袞也是。
而在這種情況下，雙方在山東雖有小的衝突，但默契的沒有爆發大戰。
明軍主動放棄了聊城，兗州，徐州，清軍得到了大片領土。
除了前期，清軍還派出輕騎追擊明軍外，後來都是清軍看著明軍撤離後才進入那些城池。
在明軍主動放棄徐州，將主力撤回江淮後，多爾袞就知道自己不可能在短時間擊破明軍，殺入江南了。
在這種前提下，就也沒必要和明軍選擇硬磕。
如果在和明軍大戰中損失過重，將來拿甚麼對抗李自成？
現在佔據山東膏腴之地，將崇禎皇帝趕去貧瘠的登萊二州，而且還佔據了南下的重要據點徐州。這種局面，對於清軍來說，無疑是有利的。
所以，比起崇禎皇帝，多爾袞更願意維持這種局面。
但雙方的備戰都沒有停歇。
多爾袞將投靠漢卒編成綠營，讓其維持清軍所佔地區內的基本局面。同時又從綠營中挑選精銳，組建新八旗。
按照多爾袞的說法，新八旗作為八旗的補充。
但凡八旗兵力有損失，便從新八旗挑選人選補充。
而綠營，新八旗，八旗的待遇完全不同，可以說是天差地別。
這就等於給了投靠漢卒一個向上的機會。
而這樣的機會，則只有最精銳的戰士才能獲得。
這無疑能提高那些漢卒為大清戰鬥的激情。
而同時，多爾袞還在天津招募船工，組建水師。
雖然因為大量船隻被朱由哲提前送去南地，但多爾袞還是得到了一些，只不過多是小船。
但朱由哲知道這個訊息後，還是吃了一驚。
多爾袞在做南下的準備。
雖然不是現在，但也足以看出多爾袞此人的謀定而動。
這是一個可怕的對手。
而同樣的，朱由哲也在做著準備。
他將衡王下的土地全部收為國有，以賞賜的方式分發給有功之臣。
而面對軍中將士良莠不齊的情況，朱由哲對之進行了改編，尤其是王俊和張君堯二人手下的部隊。
他們都是巨匪出身，手下人數眾多，但戰鬥力低下。
從之前王俊在對戰鞏阿岱的過程中就可以看出，四萬人馬短短時間內折損了一大半。
朱由哲下令清除老弱，同時那種有一定戰力，但是匪氣太重的。
此舉招致了很多不滿，也使王俊、張君堯二人心中忐忑不已，以為他這是在秋後算賬。
但等朱由哲親自找二人談過，並給二人補充了不少新卒後，他們心中的不安才略微減少。
而對於那些清除下來的兵卒，朱由哲也十分大方。
給田給糧給房。
雖不至於當個富家翁，但自此偶爾吃頓飽飯，在荒年不至餓死卻是可以的。
同時，對士卒的訓練也在不斷加強，每支新兵都配屬了一定數量的老兵，時時刻刻訓練。
凡是表現優異者，都有賞，以此提高他們的積極性。
以前的，如白桿兵，可能因為損失了一些老兵而戰鬥力不如以前，但整個軍隊的戰鬥力卻在迅速增強。
此外，朱由哲還花費大量精力在改進將士們的裝備上。
燧發槍，火銃，火藥，鎧甲，弓箭，刀，槍等。
一切的一切都在加緊製作上。
而朱由哲的哭窮的詔書更是一封接著一封發向南地。