在現代，有些人懷疑李旦和顏思齊都是被鄭芝龍謀害的。
必須承認這種懷疑是有一定依據，並且是建立在符合邏輯的推理之上的。
疑點一，是李旦和顏思齊的死，使鄭芝龍成了最大的受益者。
而且這兩人只要有一個不死，鄭芝龍都不可能有機會成為福建商幫的領袖。
至少是不可能在年僅21歲的時候，就成為那樣的大人物。
疑點二，是李旦和顏思齊的死期太過於相近，都是在1625年先後死去的。
李旦當時已是六旬老人，又經過海上的長途顛簸，病死倒還能說的過去。
可顏思齊當時卻只有37歲，正值壯年，死的確實是有些離奇。
如果他當年不死，還能得享天年的話，肯定是李旦的順位繼承人。
如此一來，福建商幫怎麼都不可能落在鄭芝龍手裡。
所以推測鄭芝龍謀殺了顏思齊也是符合邏輯的。
疑點三，是鄭芝龍上位以後，李魁奇、許心素、李國助等李旦的親友都紛紛與他作對。
這背後的原因除了利益之爭，最大的可能便是這些人掌握了鄭芝龍謀害李旦和顏思齊的證據。
但另一方面，也存在對這些推斷不利的線索，
便是楊天生、陣衷紀、洪昇等顏思齊的鐵桿兄弟，在顏思齊死後，都跟隨了鄭芝龍。
如果他們懷疑，或者是掌握了鄭芝龍謀害顏思齊的證據，又怎麼可能追隨他呢？
此外，鄭芝龍第一次接受明朝詔安的時候，因為發現明政府企圖分化他的勢力，便決定返回臺灣。
但又怕所有人同時走容易打草驚蛇，便決定分批次潛逃。
於是楊天生、陳衷紀等人就先返回了臺灣。
等到鄭芝龍從福建逃出來時，楊天生、陣衷紀等人前去接應，卻在澎湖遭遇了李魁奇。
當時楊天生、陳衷紀等人碰巧全都在臺灣染了瘟疫，自然不是李魁奇的對手，全都被其所殺。
這就說明，當時年輕人在臺灣感染瘟疫的機率還是很大的。
所以在李國助看來，鄭芝龍的崛起完全就是一個歷史的巧合，
與被其謀殺相比，李旦和顏思齊的死因更可能是在臺灣染上了致命的熱帶病。
正因如此，李國助把顏思齊拐到南海邊地來，就是為了避免他去臺灣。
這樣至少可以極大減少他因為染病而英年早逝的機率。
只要能救下顏思齊，楊天生和陳衷紀自然也不會有性命之虞。
至於便宜老爹，等到了1625年，李國助自有別的辦法阻止他去臺灣。
說完疾病對開發臺灣的不利影響後，李國助停下來思考了片刻，又繼續說道：
“除此之外，大員也是一個是非之地，盯著它的勢力實在是太多了。”
“首先倭寇就曾長期佔據大員。”
“雖然萬曆三十年，沈有容將軍已將其收復，但日本未必就會死心。”
“薩摩藩既然敢侵略琉球，難保不會野心膨脹，進一步去侵略大員。”
“其次荷蘭、西班牙等泰西諸國一直都想與大明自由通商，卻一直被拒之門外。”
“所以他們只好退而求其次，始終都想在大明沿海找一處合適的島嶼做貿易據點，以便進行走私貿易。”
“萬曆三十二年，荷蘭就曾佔領過一次澎湖，結果又是沈有容將軍趕走了他們。”
“但我認為，荷蘭人不會就此死心，還可能再次嘗試佔領澎湖。”
“可如果他們最終無法得逞，便極有可能把目標轉向大員。”
“至於西班牙人也未必會止步於呂宋，畢竟大員離大明和日本都要比呂宋近的多。”
“最後，大員的土著人也不是善於之輩，總會給我們帶來麻煩的。”
“所以像這樣一塊是非之地，沒有足夠的實力就去貿然開荒，”
“你就不怕落得個為他人做嫁衣的下場嗎？”
“嗯……”
李旦若有所悟地點了點頭，長嘆一聲說道，
“還是我兒看的長遠啊……”
他似乎還是有點不甘，突然嘶地倒吸一口涼氣，話鋒一轉，
“可若是就此放棄大員，是不是有些太可惜了？”
李國助不禁一陣無語，最後不得不苦笑一聲，說道：
“爹，我甚麼時候說要放棄大員了？”
“我給公司取名南海邊地，不止是因為要開發這塊地方，其實還暗含著對南洋的志向。”
“只是要開拓南洋市場，就必須面對葡萄牙、西班牙、荷蘭等海上強敵。”
“要對付他們，沒有一支強大的艦隊怎麼行呢？”
“而南海邊地恰恰是一處建立強大艦隊的好地方。”
“這裡有取之不盡的木材，可以讓我們打造成千上萬艘戰艦。”
“這裡遠離主要貿易路線，可以讓我們遠離是非，專心建設和打造艦隊。”
“至於陸地上來自建奴的威脅，也未必就是壞事，”
“至少這可以鞭策我們努力打造艦隊，穩固對沿海地區的佔領。”
“等我們擁有了富饒的城市作為後盾，再有足夠強大的艦隊，”
“就可以去南洋與葡萄牙、西班牙，及荷蘭人爭雄了。”
“到時候，大員就是我們進入南洋的門戶，自然是必須要佔領的。”
“而有了強大的艦隊做後盾，我們也才有底氣去佔領它呀。”
“到時候，我們還可以順手把在琉球發售股票的事情也一併解決了。”
李旦這下是徹底服氣了，由衷地讚道：
“兒呀！為父這輩子最大的成就，就是生了你呀！”
“嘻嘻，這下爹應該是再也沒有甚麼疑慮了吧？”
李國助一臉輕鬆地笑問，其實心裡緊張的很，生怕李旦還有甚麼顧慮。
“嗯，徹底沒了！”
李旦重重地點頭，並信誓旦旦地道，
“放心，從此以後，爹再也不會質疑你了，”
“你就安心地帶領顏思齊他們好好地開發這裡吧！”
李國助差點高興地跳起來，連忙拉住李旦的手撒嬌道：
“那咱們趕緊下去吧，你都這麼大年紀了，可千萬彆著涼啊。”
“好，咱們這就下去。”
李旦笑著摸了摸李國助的頭，父子倆牽著手，向城下走去。