第312章 廢案?這明明是頂刊級成果
唐師兄和幾個負責這一塊的師弟師妹們同樣坐在會議室中,這些資料就是他們昨天熬夜整理出來的成果,他們看到老師甚至都有些諂媚的模樣,面面相覷,不知道老師的葫蘆裡賣的是甚麼藥。
難道,老師真打算讓這個本科生來解決這個問題?
陳輝不知道其他人的想法,他只是專注的盯著投影螢幕。
螢幕上展示著令人眼花繚亂的圖表和資料矩陣。
“這就是我們的魔鬼,”宋朝明苦笑著調出一張熱圖,上面是數百個蛋白的磷酸化水平變化,紅綠相間,看似有規律卻又雜亂無章。
“這是我們用磷酸化蛋白質組學技術,對比了經奧希替尼處理的突變細胞和對照組,篩選出的所有顯著性變化的磷酸化位點。”
宋朝明又調出另一張複雜的網路圖,但許多連線線都是虛線或問號,“我們嘗試用現有的生物資訊學工具和資料庫去構建相互作用網路,但結果……就像你看到的,充滿了猜測和不確定性,我們缺乏一個強有力的數學骨架來支撐起這些零散的資料點。”
宋朝明的語氣從介紹資料和思路的自豪,逐漸變為面對難題的無奈和渴望。
“我們做了大量的實驗,敲低這個基因,抑制那個蛋白,看下游效應,但就像在迷宮裡摸黑走路,效率極低,而且經常走入死衚衕,我們需要一個指南針,一個能告訴我們下一步該打哪裡的模型。”
他目光灼灼地看向陳輝,充滿了期待,“小兄弟,我們擅長生成資料,擅長在細胞和小鼠身上驗證假設,但我們不擅長從這樣高維度、高噪音的海量資料中,挖掘出隱藏最深的、真正的因果邏輯。”
“這就是我請你來的原因,我們需要你幫我們建模!”
“不是簡單的擬合曲線,而是構建一個能夠真正反映細胞內訊號動態傳遞過程的計算模型,用它來告訴我們,這條見鬼的非經典通路,最可能是甚麼樣子?它的關鍵節點在哪裡?我們下一步最應該驗證哪個靶點?”
宋朝明將所有的資料和盤托出,也將最大的期望寄託在了這個年輕的外援身上,實驗室裡所有精密昂貴的儀器此刻彷彿都有規律的律動起來,它們生成的資料,正等待著一個能解讀其秘密的大腦。
陳輝的目光掃過螢幕上覆雜的資料流,眼神專注而銳利,彷彿已經穿透了表象的混亂,開始在心中構建那個看不見的數學模型。
對他而言,這不是壓力,而是一場極具吸引力的智力解密遊戲,而遊戲的獎勵,不僅是幫助宋朝明破局,更是為他自己的終極目標,奪取一塊關鍵的拼圖。
會議室中的唐師兄幾人卻已經瞪大了眼睛,他們見到剛才老師對陳輝的態度,原本以為這位本科生是有強大的背景,來實驗室鍍金的。
但從剛才老師的介紹,還有老師眼中的期待來看。
老師似乎真的想要讓這位本科生來幫助他們解決難題?
唐師兄都感覺有些錯亂,他真想讓老師自己聽聽自己在說些甚麼,從高維度、高噪音的海量資料中,挖掘出隱藏最深的、真正的因果邏輯、細胞內訊號動態傳遞過程的計算模型……
這玩意兒是一個本科生能聽得懂的內容?
不要說他們了,如果不是宋朝明見到了陳輝在圖書館構建的模型,恐怕也不會相信一個本科生能夠完成這個任務。
但現在,他充滿了期待。
“我需要一些時間。”
陳輝已經坐在宋朝明的電腦前,他們這個專案的實驗資料毫無保留的展現在陳輝面前。
但面對如此龐大,如此複雜的資料,又是完全陌生的領域,陳輝也需要一些時間來梳理這些資料,同時調整思路。
“沒問題,這間會議室就留給你,如果需要甚麼幫助隨時可以找我,如果我不在就找唐劍,他是負責這塊研究的大師兄。”
宋朝明當然也明白這模型不是一天兩天能搞定的,反而是陳輝聽完問題後沒有第一時間拒絕,就讓他感覺到了希望。
“對,我確實需要點幫助。”
陳輝像是忽然想到了甚麼,看向宋朝明說的那位大師兄,“接下來的幾天,我需要幫忙帶下飯。”
“?”
唐劍先是一愣,旋即回過神來。
這傢伙難道還真準備在這兒研究?
這讓他不得不重新打量陳輝,如果這傢伙真要在這兒研究的話,說不定還真有兩把刷子。
不過他的確想不出一個本科生要怎麼解決這個問題,他腦海中根本想象不出來半點這個畫面。
“讓你帶飯呢,有問題嗎?”
宋朝明見唐劍半天沒有回應,眉頭一擰。
看見自己這些不成器的學生,再跟陳輝一對比,他就很氣。
“沒問題。”
唐劍毫不猶豫,斬釘截鐵的說道。
“那就拜託小兄弟了。”
“這臺電腦裡面有全部的實驗記錄、原始資料和失敗的分析報告,具體內容有甚麼疑問也可以找唐劍。”
宋朝明看向陳輝時,已經是滿臉笑容,儼然已經把陳輝當成實驗室二把手的態度。
他也不知道陳輝到底能不能解決這個問題,但從今天下午陳輝展現出來的實力來看,如果陳輝都解決不了,或許,他們真的要構思其他的方案了。
很快,小會議室中就只剩下陳輝一人。
沒有急著建模,他開啟宋朝明指出的資料夾,從最開始兩年前的資料開始看起,一個資料一個資料的研讀起來。
三天時間一瞬即逝,陳輝終於將所有資料閱讀完。
凝神思考好半晌後,陳輝開始建模。
他使用宋朝明團隊未曾使用過的更高階的多元統計方法,主成分分析PCA、偏最小二乘回歸PLSR,來降維和提取特徵。
完成建模後,將模型和實際資料匯入模擬軟體,結果略有改善,能看到一些聚集趨勢,但依然無法釐清因果關係。
再次思考了幾個小時後,他開始著手構建一個包含所有異常蛋白的非線性相互作用模型,這一次,他引入了微分方程。
模型引數極多,擬合結果看似很好,但過擬合了,模型完美地復刻了包括噪音在內的所有資料,卻不具備預測能力,無法透過新資料的驗證。
看著最後的結果,陳輝皺起眉頭。
他意識到這個問題的確沒有那麼簡單,即便是他,也同樣被資料的複雜性和噪音所迷惑,陷入了海量噪音構成的泥潭中。
他需要從這些噪音中抓住那些關鍵的真實資料!
陳輝目光銳利的看向螢幕上的資料。
暫時的失利並沒有讓他氣餒,他最擅長的從迷霧中尋找真相,這是高達9級的洞察力給他的底氣。
咚咚咚!
會議室門被敲響。
“進來。”
陳輝揉了揉額頭,看了眼電腦上的時間,已經是中午12點多,吃個飯休息一下吧。
唐劍提著飯盒走進來,將飯盒放在會議桌上,笑著說道,“今天給你帶的是鐵板牛肉,平時我們自己也挺喜歡吃的,牛肉鮮嫩多汁,搭配秘製醬料,很下飯。”
“謝謝。”
陳輝真心實意的感謝,這些天唐劍帶的飯菜都還是很豐盛的,有幾次他甚至還特意跑到校外去買特色菜,這五天時間陳輝還沒吃過重樣的菜,這位唐師兄顯然是費了心思的。
陳輝還是很滿意的,這幾天吃得的確不錯,當然,他也不挑食就是了。 “客氣。”
“我們實驗室可就指著你出成果呢,那可不能怠慢了。”
唐劍笑盈盈的說道。
這些天他跟陳輝接觸不少,不知道為甚麼,他竟然覺得眼前這個年輕人給他一種很可靠的感覺,這種感覺來得莫名其妙,卻毫不客氣的壓倒了他的其他想法。
陳輝笑了笑,沒有說話。
他的研究的確遇到了困難,有點沒有底氣說話。
“你已經完成建模了?”
忽然,唐劍看到了陳輝電腦螢幕上的模擬結果,笑容僵硬在臉上,瞪大的眼睛就像金魚一般,都快要凸出來了。
他沒想到這個本科生竟然真的完成了資料處理,這完美的結果,他們幾個博士生搞了幾個月都沒有做出來。
“還差得遠。”
陳輝吃了一塊牛肉,搖了搖頭,“過擬合了,沒辦法用這個模型進行預測。”
這牛肉倒是真如唐劍所說,鮮嫩多汁,但陳輝覺得,這道菜的精髓還在這醬汁上,饒是吃慣了山珍海味的他,也覺得這道菜吃起來很不錯。
“啊?”
“過擬合了?”
唐劍瞪大眼睛,湊到螢幕前,仔細研究了好長時間,才終於發現陳輝說的問題。
但這個問題在他眼中根本就不算問題,跟理論數學不一樣,理論數學要求結果絕對的正確,最好是公理、定理這種絕對正確的東西。
實際實驗卻並不需要,只需要能夠滿足一定的精度就已經足夠了。
如果他能夠做出這樣的結果,早就跑去發論文了。
“這個結果已經足夠完美,我現在就去通知老師。”
唐劍說著往實驗室外走去,滿臉興奮之色。
“不著急,這個模型還能改進,等最後結果出來再說吧。”
陳輝擺擺手,拿這樣的結果去糊弄人,他還真丟不起這個人。
唐劍站在會議室門口,看看展現著模型結果的電腦螢幕,又看看陳輝,一時間不知道該說些甚麼。
一方面他聽到陳輝說結果還能再改進,他心中充滿了期待。
可他認為這個結果已經足夠完美了,他很難相信這個結果還能再改進。
在他看來,這個模型已經完全可以用於實際應用,根本就不需要再做改進,根本沒必要浪費時間。
不過最終在一陣糾結之後,他還是決定聽陳輝的,都已經等了好幾個月了,再多等幾天也無妨。
……
唐劍剛走出會議室,就有一個師妹走了過來,低聲對他說道,“大師兄,那傢伙都快一週沒有出實驗室了,他是真在研究還是在這兒蹭吃蹭喝啊?”
不止是這位師妹,實驗室中其他師弟師妹們也都向這邊看來,他們也很好奇。
不僅是好奇,他們對陳輝的看法也很複雜,如果是他們,讓他們在會議室裡住幾天,他們必定無法忍受,即便因為他們做實驗偶爾也會熬夜,所以會議室中有個行軍床。
可但凡有得選,他們也會選擇回寢室享受自己的大床,而不是在這兒受罪。
這樣的精神讓他們震撼。
但他們實在無法想象一位本科生能解決這麼複雜的問題,所以陳輝的行為在他們眼裡就有點作秀的嫌疑了。
“住嘴。”
“你怎麼能這麼編排陳師弟?”
“太不禮貌了。”
唐劍神色一歷,怒聲呵斥了這位師妹一句。
實驗室中其他人都是瞳孔地震,呆愣在位置上,一時間竟然有些茫然。
他們以前哪裡見過大師兄這幅忿怒金剛的面孔。
大師兄在實驗室一貫是好好先生,不要說這般嚴厲的呵斥,就是一句重話都沒有對師弟師妹們說過,平時哪怕是有師弟師妹們闖禍了,他都不會太過嚴厲的斥責師弟師妹,反而是會去老師那頂罪,讓師弟師妹們免受懲罰。
“好教你們知道,”
唐劍看向實驗室中神色各異的師弟師妹們,“陳師弟已經做出成果了!”
“模型的擬合度幾乎完美,這樣的成果足以發表一篇頂刊,如果加上我們完整的課題,上《細胞》、《自然》或者《科學》都沒問題。”
呼呼……
一陣微風吹過實驗室。
實驗室中眾人就像是石化了一般,那個本科生竟然真的完成了建模?
他們覺得大師兄今天可能是中邪了。
“那還等甚麼,趕緊寫論文啊,他的模型在哪?”
一位師弟忽然說道,“我現在就去通知老師!”
“不用了。”
唐劍擺了擺手,“陳師弟還在改進模型,等精度更高的模型出來後再說吧。”
聽到這話,實驗室中的師弟師妹們頓時你看看我,我看看你,眼中滿是狐疑之色,感覺大師兄的話的可信度頓時大打折扣。
如果真是能夠上《細胞》、《自然》、《科學》的成果,那還能怎麼改進呢?
開創一個新時代?在腫瘤研究領域稱宗做主,成為數學界高斯、尤拉般的存在?
即便他們是華夏頂尖實驗室的頂尖博士生,也還沒狂妄到這種地步,他們甚至做夢都沒這麼想過,他們想都不敢想的事情,難道一個本科生還真能做到?
無稽之談!
唐劍搖搖頭,沒有再多說甚麼,他現在說甚麼都是蒼白的,只有模型擺在這些傢伙面前,才會讓他們改變想法。
不管陳師弟最後能不能成功改進模型,即便是陳師弟現在的模型,就足以讓這些傢伙為自己現在的想法感到慚愧。
他相信這一天並不會等太久。
(本章完)