沒有人知道聖吉列斯、阿爾法瑞斯和輪迴之終末談了些甚麼，但等電梯回到地面上的時候，九頭蛇之首已經帶著他的戰士們站在了大天使的身邊……
聖吉列斯的這一決定受到了戰士們的反對，但最終在輪迴之終末的擔保下，戰士們還是勉強接受了這一事實，實際上在十年前的戰鬥裡，除了先鋒小隊失蹤之外，阿斯塔特們並沒有受到甚麼損失，就是有幾個被打成重傷塞進了無畏裡……損失多的是尤爾哈們，不過後者可以隨時上傳自己的意識，反而甚麼傷亡也沒有。
現在，經過十年的時間，沒有羅夏的火星基地在共生體們的幫助下，對原先的UEF武裝進行了大規模升級。同時，在穩定了量子網路之後，量子閘門在第一時間便被建立起來，等聖吉列斯等人從那之門來到此地後，已是第十年的十月份了。
在這段時間裡，尤爾哈和星際戰士們也沒有閒著，他們沿著混亂的量子資訊一個個搜尋過去，在這之中找到了很多個世界，建立起來了世界之間穩定的量子閘門。
其中有幾個世界甚至被選為了星際戰士們的徵兵地，雖然目前主流的徵兵方法仍然是透過戰團智庫領著藥劑師們前往各個世界蒐集兵源，但是缺少了羅夏之後，這一行動變得有些困難，已經無法像之前那樣精準地找到兵源，而是隻能將範圍縮小到半徑五公里的圓內，若是鄉村還好，要是那種大城市的話……這再怎麼說也是有些低效，更不用說還可能受到當地政府的關注，引來不必要的麻煩。
一個穩定的徵兵地必不可少，同時，就算基因檢測不合格，無法高几率地透過改造手術，落選的那些人也可以成為阿斯塔特輔助軍，這些輔助軍們被稱之為“錫拉守衛”。
憤怒戰士戰團的阿斯塔特們在這個世界上摧毀了生活在地下網道中的獸族，把那個所謂的女王抓出來吊死，又讓留在監牢星系的圓環修會的達芬奇賢者帶著一幫機械神甫們解決了所謂“伊姆能源”問題……接管了那顆星球之後，一個高大的量子閘門被建立在錫拉星的賈辛圖高原上，尤爾哈的指揮官連隊重建了人類的城市，規劃了發展的路線，並派駐了人員監督新政府的執行。
錫拉星的新兵主要會進入憤怒戰士戰團，而榮耀騎士們也有自己的徵兵地，那是一個生機勃勃的世界，無數稀奇古怪的怪物生存於上，而那裡的人類則是發展處一套狩獵的體系，也就是說，在那裡有各類封建王國和一個橫跨所有人類國度甚至是亞人類國度的組織：獵人公會。
榮耀騎士們與之進行了接觸，在經過一系列的談判之後，監牢星系將會為獵人公會提供必要的醫療援助，幫助當地人獵殺那些威脅生態平衡和人類定居點的強大怪物，作為回報，此地在獵人公會登記的獵人必須接受基因檢測，基因合適的人在榮耀騎士戰團進行必要性徵兵時不得拒絕。
有人反對過這樣的決定，但所有的反對聲音都在數百架從天空駛過的雷鷹戰機投下的陰影中消失，不過在瞭解到了阿斯塔特們所進行著的戰鬥之後，立刻便有獵人願意加入，畢竟……在無盡宇宙中狩獵，為無盡宇宙的秩序文明而戰，這個理由已經足夠吸引那些年輕的獵人們了。
而這些被選中成為榮耀騎士的獵人們在自己的星球上被稱為“蒼藍星”。
同時，進入榮耀騎士和憤怒戰士戰團的新兵們，每隔幾年便會返回自己的母星看望自己的家人，這也是兩位戰團長的想法：
他們認為在這樣高強度，橫跨宇宙的戰鬥中，定位自己的歸屬是一件極其重要的事，阿斯塔特不應該僅僅只成為一名戰士，帶來死亡的天使，而更應該成為一名守護者，每一次的歸鄉都是在強化這個守護秩序的概念，而且這樣也有助於刺激當地勇敢的年輕人參加戰團和輔助軍。
對於尤爾哈們來說，羅夏的失蹤確實在相當長的一段時間裡造成了巨大的影響，相當部分的尤爾哈人形在那段時間裡的工作效率極低，也有那種狂熱工作找回羅夏的，但好在類似的事情曾發生過，羅夏也留下了相應的預案。
經過尤爾哈司令官和一批足夠理智的尤爾哈們疏導之後，尤爾哈人形們也算是走出了部分陰影，但更加極端的那一派尤爾哈卻是潛伏了下來……
在聖吉列斯和阿爾法瑞斯加入火星基地之後，原體們知曉的技術也為基地的發展貢獻了相當大的幫助，在共生體們的協助下，數種戰爭機器都加入了UEF戰爭軍團的行列中，而尤爾哈艦隊也重建完畢，並對戰艦效能進行了大幅度升級，以滿足未來可能發生的大規模作戰行動。
圓環修會在因為量子閘門的波動而無法聯絡上帝國那邊之後，這些機械神甫們便團結在達芬奇大賢者的身邊，與尤爾哈們簽訂了新的盟約，並致力於發掘各個宇宙中的奇特科技，以期有朝一日能夠帶著這些科技回到帝國中，為帝國的發展儘自己的一份心力，同時，他們也有著將歐姆彌賽亞的榮光散播到無盡宇宙中的野心。
跟著聖吉列斯來到此地的聖血天使們也漸漸甦醒，以阿密特為首的聖血天使們成為了大天使的衛隊，而那些被放入無畏的戰士們則是被編入了榮耀騎士戰團中，作為火力支援和戰場支援。
也就是看到了這些戰士們，加維爾·洛肯和納撒尼爾·伽羅兩人才感受到了時間的流逝，阿密特的鬢角已經染上霜白，曾經桀驁而俊美的臉上也出現了深刻的皺紋……
“阿密特，在你開始你的工作之前，我建議你去個地方……那個孩子可能還在等著你。”
“……我知道了。”
在聖吉列斯和阿爾法瑞斯正式加入火星基地的兩個月後，各項工作穩步進行的時候，尤爾哈們找到了第一個失蹤的先鋒小隊成員的訊號。
與此同時，或者說，在更往前一點的時間裡——
憤怒戰士戰團智庫，先鋒小隊成員之一的碇真嗣，從自己家的房間裡走出來，他現在身上穿著一身寬鬆的袍子，奈米化的戰甲凝結成生化服內襯在寬鬆的袍子之下。
碇真嗣正準備下去吃點東西……在離開三十年之後，他回到了自己的故鄉世界，但令智庫驚訝的是，這裡居然只過了三天！看起來每一個世界在未聯絡在一起之前，時間的流速都是不同的。
“真、真嗣……”
碇真嗣父親的親戚戰戰兢兢地將一封信交給了碇真嗣，前者無法理解失蹤了三天的孩子回來為甚麼會變成一個……北斗神拳畫風的人，但是房間裡出現的劇烈閃光和狂風是跟他消失時是一樣的，而這個壯漢也能準確地描述出每一件過去的事，所以，收養碇真嗣的親戚們也能夠暫且相信這件事了。
“這是你父親的信……他讓你去新第三東京市。”
“好，我知道，”碇真嗣無悲無喜地接過信件，他繞過男人向廚房走去，走到一半，智庫回頭說道：
“姑父，你最好去檢查一下你的肝臟，還有，少喝點酒。”
“……啊，誒？謝謝，額……”
“跟以前一樣叫我真嗣就好，這樣就好。”
碇真嗣摩挲著信件，垂下眼眸。
父親……哈……現在的我該怎麼稱呼你呢？