在荷魯斯叛亂結束之後，整個帝國像是被刺激到了一般向著更美好的未來前進，在這段時期的人類帝國達到了國力的最巔峰。
每一分每一秒都有新的星球被發現，被殖民，被拆分出來的戰團所保護，帝皇的利劍與重錘無時無刻不在巡弋著整個帝國……人們突然發現，在沒有帝皇發號施令的情況下，帝國似乎也能很好的延續下去。
但這段被後來的歷史學者們稱為“重鑄期”的千年歲月並不是甚麼大事也沒有發生的，這其中影響最深遠的事件便是國教的壯大和基因原體們的失蹤。
在第三十二個千年的某年，前身為救世帝皇聖殿成為帝國官方承認的宗教，並被給予帝國國教的稱呼，不僅如此，第一任教皇也被接納成為至高領主的一員。
對此，阿斯塔特軍團議會表示不滿和擔憂，但仍然健在的兩名原體，攝政王聖吉列斯和帝國攝政羅伯特·基裡曼在分別面見了兩名禁軍信使之後，也保持了沉默。
至於其他的原體……他們都失蹤了。
鋼鐵之手軍團的基因原體，美杜莎之主，費魯斯帶著他的衛隊在一次原體議會之後消失，他的臉上帶著憤怒和無可奈何，在之後便再也沒有人看到過他的身影，但也有傳言說，原體曾面見過帝皇……最終，人們只在美杜莎上原體的房間裡找到了一份厚重的軍團拆分計劃、未來建設指導和幾句對鋼鐵之手們的簡短訓話。
在那之後，鋼鐵之手們仍然延續著自己的戰術和傳統，但與帝國其他勢力的合作多了起來，人們驚奇地發現，鐵手們居然會在開炮之前跟友軍打聲招呼——這真的是個巨大的改變。
與費魯斯相同的是黎曼·魯斯，後者消失在了一次宴會之後，而從那以後，野狼們也開始了自己的狩獵遠征，響應每一個求援訊號，僅僅只過了幾百年的時間便沒有人再記得他們那劊子手的稱號了。
帝國之拳的原體羅格·多恩在與墮落者佩圖拉博戰鬥之後消失，伊斯塔萬V被悲痛的帝拳們收復，隨後便被帝國殖民，而第七軍團也將此地選為自己的徵兵星球之一。同時，帝國之拳還肩負著守衛泰拉和太陽星域之外的主星門樞紐星系的重任。
千瘡之子的原體馬格努斯和黑暗天使的原體一樣都陷入了沉睡，他們麾下的戰士開始以帝皇和各自原體之名征戰於銀河之中，但是千瘡之子軍團活人的總人數在最巔峰時也未超過3000名。
黑暗天使的巨石要塞開始從帝國的各個世界徵兵，在軍團被拆分之後，母團與子團仍然保持著過於親密的聯絡，對於這一現象，審判庭曾進行過調查，但莫名其妙的損失導致最終還是不了了之。
巧高里斯的戰鷹，察合臺可汗在發現自己的母星遭受到黑暗靈族的劫掠之後，便憤怒地率領數個白色傷疤連隊追擊而去，但至今仍未返回。自他消失在網道之內後，白色傷疤們開始著手拆分軍團和整頓母星周邊的星域，在完成了這一工作之後，這些狂野的戰士們便開始了自己的遠征。
暗夜守衛的原體在某日拜訪了夜曲星之後，帶著火龍之主打造的強大武器消失在恐懼之眼內。據恐懼之眼外的守軍報告，科拉克斯在注視著恐懼之眼數天之後便化作一團陰影消失，從此便再也沒有他的訊息。
而夜曲星上的火龍之主伏爾甘在恢復了軍團戰士的數量，並指導了軍團的拆分後也同樣消失了，但在走之前，他為火蜥蜴們留下了一批強大的武器和一個奇特的信標。
帝皇之子們收復了自己的母星徹莫斯，他們表示不會再拆分軍團，同時人數將保持在一萬左右，隨即，這些浴火重生的戰士們便開始在整個銀河的範圍內追捕那些叛亂的帝皇之子，即現在的完美之主……
新任的戰團長所羅門將扭轉帝國人民對帝皇之子的惡感作為終身的重任，同時，他也將和戰團內新設的監察官一起警惕戰團內對“完美”的過分追求，防止墮落的再一次發生。
至此，帝國仍然健在的原體便只剩下了兩個。
但在第三十二個千年的第五個百年，帝國攝政，極限戰士軍團的原體，奧特拉瑪之王，羅伯特·基裡曼在剿滅某個星球的混沌叛軍時，被墮落的死亡守衛原體莫塔裡安和納垢大魔“雨父”羅提格斯聯手伏擊……
羅伯特·基裡曼身中劇毒，在其子嗣們的拼死搶救下被帶離戰場，放入了靜滯立場中，在被放入的前一秒，他的面容仍然保持著堅毅，用自己的意志對抗著痛苦。
隨後，那顆星球便在趕來支援的，帝國攝政王，聖血天使基因原體聖吉列斯的暴怒下化作宇宙中的塵埃，聖血天使和帝國海軍的龐大艦隊將整個星球徹底湮滅在光矛、宏炮和旋渦魚雷之中！
而攝政王本人則在自己兄弟面前佇立三日之後，帶著聖血天使軍團前往帝國邊疆，開始剿滅那裡逐漸興起的異形，一直到今日。
“這便是這一段時間以來人類帝國的歷史，我說的對吧，圓環修會的賈布里·德西瑪大賢者？”
“……你有甚麼目的？”
“哈……我只是一個小小的收藏家而已，不要用這種憎恨的眼神看著我啊，人類，哦，人類，你們總是這樣，”這個古怪的、閃著綠色熒光的骷髏張開雙臂如此說道，它的腳下躺著數具隸屬圓環修會的精銳護教軍，而大賢者本人的衛隊早已在數分鐘之前的戰鬥中被某種強大的武器所消滅，只餘下點點灰燼。
“等一下，我似乎還沒有進行過自我介紹——這太失禮了！”
索勒姆納斯之主像個人類一般微微鞠躬行禮，它的言語之中帶著沒有一絲虛假的歡喜和無盡的傲慢，從見到圓環修會大賢者的第一刻起，這個太空死靈的古老霸主便感到此行不虛！
“你可以稱呼我為‘無盡者’塔拉辛，正如你所見的那樣，我是個收藏家。”
站在可怖異形面前，身單影只的圓環修會大賢者賈布里·德西瑪默默地啟動了動力齒輪斧的能量立場……
自此開始，圓環修會的機械神甫和賢者們便在整個銀河的範圍內，搜捕這個名為塔拉辛的太空死靈霸主和它統治下的星球索勒姆納斯，他們認為找到這顆星球便能將創立修會的賈布里·德西瑪大賢者救回，洗涮自己身上的恥辱。
在圓環修會開始搜捕塔拉辛和著手建造第三個星門的時候，一份來自死亡守望戰團的報告擺在了至高領主們的面前。