武德九年六月初一丁巳日，太白金星在白天出現於京都長安天空正南方的午位，皇甫玉此時正在太子府中做幕僚，他跟太子李建成和齊王李元吉說道：“天生異像，這是要’變天’的徵兆，太子和齊王你們要小心了，秦王恐怕要反擊了。”
皇甫玉雖然知道後來走向，他顧忌天機不可洩露，也沒有把更多的事情告知太子李建成和齊王李元吉。前段時間太子李建成和齊王李元吉雖然透過外出征討匈奴，把秦王李世民手下的一些武將支配了出去，畢竟顧忌著李世民手下良將眾多，他們還是有所保留。
最主要一點皇甫玉現在也被袁天罡派來的人收買了，這這次主要還是潛伏在太子府內做一件袁天罡交代的事情。
太子李建成和齊王李元吉聽了之後，覺得動手之時已來到了，加快了密謀的腳步。前段時間太子李建成和齊王李元吉拿了重金要挖走尉遲敬德等人，他們碰了一鼻子灰，實在想不到秦王的這些手下還是忠心耿耿跟隨著李世民，任憑太子這邊怎麼利誘還是不為所動。
這邊太子李建成和齊王李元吉密謀著，那邊秦王李世民這邊的人群壓力也越來越大，越來越感覺到太子這邊要把他們排擠出去的氛圍越來越濃烈。
李世民手下房玄齡和長孫無忌等人按捺不住，紛紛勸說李世民不要有婦人之仁，要不就會像前幾天一樣不是差點被毒死，就是日後太子李建成登基後也會被設法殺死，他們這幫原先李世民手下的大臣，也會遲早受到牽連，貶走的可能性極大，被設法割職或被殺都是有可能發生的。
這兩幫人都有自己的小九九，都想要把自己的利益維護好。
皇上李淵優柔寡斷，當初說要把太子之位讓給南征北戰多打勝仗的李世民。可每當李世民一得勝回京，李淵都沉浸在花天酒地中，對李世民的許諾似乎都忘了，隨後還聽從太子李建成這邊的建議，把秦王府中相好的將領和謀士分派到各地，還企圖拉攏過去為他們所用。
在太子的東宮中擔任率更丞職位的王晊，已早被秦王李世民收買，成為李世民在東宮的眼線，他悄悄告訴李世民：“太子對齊王說：‘現在，你已經得到秦王驍勇的將領和精銳計程車兵，擁有兵馬數萬之多了。我與秦王在昆明池為你餞行，讓勇士在帳幕裡將秦王殺死，上奏父皇時就說他暴病身亡，父皇應該不會不相信。我自當讓人進言，逼父皇將國家大事交給我處理。尉遲恭等人已經落到了你的手中，應該將他們悉數坑殺，自此誰敢不服？’”
李世民將他的話告訴了長孫無忌等人，長孫無忌等人勸李世民先發制人。
六月初三己未日，太白金星再次在白天出現在天空正南方的午位。大臣傅奕秘密上奏李淵道：“金星出現在秦地的分野上，這是秦王要擁有天下的徵兆啊。”
李淵還將傅奕的密奏給秦王世民傳看。李世民看了之後，趁機秘密上奏父皇李淵，說李建成和李元吉與後宮的嬪妃淫亂，並且說：“兒臣絲毫沒有對不起皇兄和皇弟，現時今他們卻打算殺死兒臣，這簡直就像要替王世充和竇建德報仇一樣啊。”
李淵驚訝地望著李世民，有點遲疑，過了片刻才說道：“你應該早日告知我這件事情啊，朕這就命人通知他倆，明日朕就審問此事，你也一起前來。”
武德九年六月初四庚申日，李世民率領長孫無忌、尉遲恭、侯君集、張公謹等人入朝，並在玄武門埋下了伏兵。
李建成、李元吉他們二人不知底細，應召一起準備入朝，騎馬奔向玄武門。
皇宮內，李淵將裴寂、蕭瑀、裴矩等人召集前來，準備查驗太子李建成他們要殺李世民這件事情的真相了。
當李建成、李元吉來到臨湖殿，察覺到了氣氛異常有變化，他們立即掉轉馬頭，準備向東返回東宮和齊王府。
李世民見狀不妙，跟在後面呼喚他們。李元吉有點心虛，先張弓搭箭射向李世民，但由於心急，一連兩三次都沒有將弓拉滿，箭並沒有射中李世民。
那李世民見了，搭弓射向李建成，一箭正中，將太子李建成當場就射死了。
尉遲恭帶領騎兵七十人相繼趕到，他身邊的將士用箭射中了李元吉，李元吉跌下馬來。可就在此時，李世民的坐騎也受到了驚嚇，帶著李世民奔入玄武門旁邊的樹林。李世民又被林中的樹枝掛住，從馬上摔下倒在地上，一時爬不起來。
那李元吉隨後趕到，奪過弓去，準備勒死李世民。就在這時，尉遲恭躍馬奔來大聲喝住了他。
李元吉知道不是對手，趕緊放開李世民，想快步跑入武德殿尋求父皇庇護，但尉遲恭快馬追上他，放箭將他射死了。
太子李建成的部下、翊衛車騎將軍馮立得知建成身死，嘆息道：“難道能夠在太子生前蒙受恩惠，而太子一死便逃避禍難嗎！”於是，他與副護軍薛萬徹、屈直府左車騎謝叔方率領東宮和齊王府的精銳兵馬兩千人，急馳趕到玄武門，準備為太子和齊王報仇。
張公謹臂力過人，他獨自關閉了大門，擋住馮立等人，馮立等人一時無法攻入。
雲麾將軍敬君弘掌管著宿衛軍，駐紮在玄武門。他挺身而起，準備出戰，與他親近的人阻止他說：“事情未見分曉，姑且慢慢觀察事態的發展變化，等到兵力彙集起來，結成陣列再出戰，也為時不晚。”
敬君弘不聽從，便與中郎將呂世衡大聲呼喊著向對方衝去，結果全部戰死。
把守玄武門計程車兵與薛萬徹等人奮力交戰，持續了很長時間，薛萬徹擂鼓吶喊，準備進攻秦王府，秦王府將士們大為恐懼。
此時尉遲恭提著建成和元吉的首級給薛萬徹等人看，東宮和齊王府的人馬頓失戰心，迅速潰散，薛萬徹與騎兵數十人則逃入終南山中。
馮立殺死敬君弘後，對部下說：“這也可以略微報答太子殿下了。”於是，他丟掉兵器，落荒逃回了太子府。
路上馮立憶起昨日皇甫玉私底下跟他講的話，一旦太子李建成和齊王李元吉不測，不可戀戰，要他趁亂逃出長安，護送太子李建成的幼子李承乾和他姐姐李婉順往建鄴而去。
回到太子府一看，皇甫玉整理好了馬車和馬匹已等他們多時了。馮雲見狀，對逃回的部下說道：“皇甫先生洞察先機，是非常人，我們當聽從他的指令，護送幼子和公主去東南邊地區，不得耽擱了！”
眾部下聽了，齊聲說好，跟隨著馮立翻身上馬，當天趁亂擁著幼子李承乾等人就出了長安。