夜晚其實是不適合作戰的，而且這還是海戰。因此，雖然在聊天群的聯絡下，水陸配合無間，鄭芝龍和葡萄牙人的船隊剛好在紅夷逃到船上的時候及時出現，又有縱火船去堵港灣，外圍又散開其餘戰船，可終歸還是被紅夷逃了一些船出來。
在港口火勢的映照下，水師戰船靠了上去，勾住了其中一些紅夷的船進行跳板戰。而且，只要有一艏被勾住，明軍這邊往往是幾艏一起攻擊一艏，以眾凌寡。此時的紅夷，又哪來的戰意，基本上就沒有激烈的抵抗。
但不管怎麼樣，終歸還是被紅夷逃出了三艏戰船。雖然葡萄牙戰船和鄭一官的戰船都有追趕，但海面遼闊，怕是無法全殲紅夷了。
此時，月亮掛在空中，月光灑在大地，天色已經完全黑下來了。這一場殲滅紅夷，奪回臺灣的戰事，已經可以宣告結束。劉金生和鄭芝菀先後把海陸戰況都在聊天群內做了稟告，並附有戰役照片。
崇禎皇帝看到，很是滿意。他當初吩咐下去的原則，就是要用最小的代價，儘快把紅夷殲滅。如今對紅夷這一仗，沒有像原本的歷史上，和鄭成功一樣用圍困的方法，耗時耗資而打敗紅夷，這就節約了很大的兵力和物資了。
“陛下，已經確認，紅夷總督普特曼斯的旗艦在逃走的三艏戰船中。”劉金生在過了一會後，又馬上向崇禎皇帝稟告道，“海面堵截有空隙！”
他這隱隱的意思，就是說鄭芝龍失職。
但崇禎皇帝見了，卻並沒有做出他所希望的事情，反而回答道：“無妨，回頭發出告示，曉瑜天下，並傳南洋，宣佈紅夷總督之罪責，我大明誓必將所有在大明犯罪之紅夷，繩之於法。”
這其實也就是“犯大明天威者，雖遠必誅！”的海上版本，臺灣的紅夷，老巢被端，主力被殲，已經是達到了作戰目標。而逃走的三艏戰船，又剛好成了大明以後出兵南洋的藉口之一，這種情況，對於目標長遠的崇禎皇帝來說，其實是樂見其成的。
幾天以後，朝廷宣佈在臺灣設縣，在島上的所有逃民，凡自覺在限期內往縣治所在登記造冊，則往事一律不再追究。如果是換了以前，官府貿然登岸，宣佈這策的話，怕是會引來逃民的反抗。可經過了紅夷的事情後，島上的逃民，已經深深地知道了一個道理，官府雖然收稅，卻能保護他們。如果沒有了官府，他們只是待宰的羔羊而已。有了陳明等人的現身說法，朝廷在臺灣設縣治的事兒，推進地非常順利。
於是，在福建巡撫的管轄下，又正兒八經地多了一個臺灣縣。
至此，大明東南沿海，海盜都逃亡南洋，幾乎絕跡，而紅夷也被大明水師殲滅，剩下的海上武裝力量，在澳門的佛郎機人，在見證了大明的水師力量，見證了紅夷的下場之後，表現得很乖！
於是，李芝奇的登萊水師，在南洋返航的糧船到達之後，就護送著糧船返回北方。
在這其中，臺灣一戰，論功行賞，有鄭芝龍的人擔任了登萊水師中的中級官職，也有李芝奇的手下擔任了福建水師中的中級官職，互有混雜。任何人一看就知道，這是朝廷防止一家獨大，混編起來有利於控制。對於李芝奇和鄭芝龍來說，他們肯定是不希望這樣的。可朝廷這麼做，他們也沒有辦法。更何況，在兩個死對頭的身邊，都有對方最親近的人跟著。平日裡如果想憑藉手中權勢刁難那些混調過來的人，也不會那麼容易。對於這種情況，也只能是認了。
解決了大明東南沿海的海盜問題，三省總督孫傳庭的奏報中，明顯提到了大明海商在增加，海稅的收入，又開始突飛猛進的事情。這讓崇禎皇帝很是高興，隨著時間的推移，相信參與海貿的人，還會更多。開海一事，進入了良性迴圈。接下來，澳門的葡萄牙人表現得還乖順，就暫時先放過他們。先行發展水師，等水師足夠強大之後再說了。
崇禎皇帝想完這些，就拿起御案上放著的一本奏章，又再次看了起來。這份奏章很厚，是錦衣衛指揮使劉興祚遞上來的。回頭他又拿起另外一本奏章，這是東廠提督王承恩遞上來的。
崇禎皇帝兩本放開，各自檢視了一番之後，心中做出了決定，抬頭對身邊的輪值太監吩咐道：“傳劉興祚、王承恩覲見！”
第998章江湖追殺令
沒多久，劉興祚和王承恩兩人併到了御前，行禮完畢，崇禎皇帝便把兩份奏章換了下，讓內侍轉給他們兩人道：“衛所軍制的革新，事關重大，朕不容許有任何差錯！這才開始，就有好多個來京師兵部和吏部跑官，不是想要繼續世襲武職，就是想換去都察院衙門。不想著按規定選拔，反而就幹這些歪門邪道之事！此風決不能長，必須在衛所軍制革新之初就抑制住！”
聽到這番話，兩大巨頭便互相看了一眼，都明白皇帝這是要用他們這把刀了，心中隱約有點興奮。
果然，崇禎皇帝接下來，就聽他說道：“證據確鑿地這些人，兵部和吏部所屬官吏，直接抄家，人員流放歸化。而行賄之人，取消當前所屬品級，廢為庶民，另除罰沒行賄金之外，另外再罰十倍行賄金，資不抵債者，流放臺灣縣。”
不管是北方的歸化城，還是南方新成立的臺灣縣，都需要大量有文化的漢人去充實。獲罪的官吏，就是最好的人力來源了。對這種犯罪，與其一刀砍了，還不如壓榨他們的剩餘價值為好！
“末將（奴婢）遵旨！”劉興祚和王承恩聽了，幾乎異口同聲地回應道。
這種跑官的事情，其實是最普通不過的事情，所有人都知道。但這事還沒到滿清時代的明碼標價，多是在暗地裡進行，畢竟是上不得檯面的事情。而且，跑官也不止是用銀錢行賄，還包括人的各種需求。只要負責人事的官吏能滿意了，就能運作到自己想要的官職。
有的跑官，是很難查的，最容易查的，反而是用銀錢行賄這招。崇禎皇帝也知道，跑官的事情，沒辦法從根本上杜絕。但他不介意，揮動下廠衛這把屠刀，先把容易抓獲證據的這些給抓了，要的就是殺一儆百，至少能讓下面收斂一點。